More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3497 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3433  aminotransferase class V  99.47 
 
 
568 aa  1111    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3351  aminotransferase, putative  96.31 
 
 
570 aa  1054    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3419  aminotransferase class V  72.7 
 
 
571 aa  785    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.421633  normal  0.0439943 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3497  aminotransferase class V  100 
 
 
573 aa  1126    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3637  aminotransferase class V  47.69 
 
 
570 aa  424  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2695  aminotransferase, class V  51.04 
 
 
570 aa  425  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.370695  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1443  aminotransferase class V  44.96 
 
 
557 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1625  aminotransferase class V  41.45 
 
 
499 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2548  aminotransferase class V  43.86 
 
 
499 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0469  aminotransferase, class V  44.29 
 
 
551 aa  353  5.9999999999999994e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2103  aminotransferase, class V  45.93 
 
 
474 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3175  aminotransferase class V  40.94 
 
 
492 aa  336  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2795  aminotransferase, class V  36.8 
 
 
495 aa  333  6e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.691488  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0409  aminotransferase, class V  43.09 
 
 
473 aa  330  5.0000000000000004e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.950818 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3990  aminotransferase, class V  34.89 
 
 
494 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2014  aminotransferase, class V  36.56 
 
 
502 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39592  predicted protein  43.25 
 
 
495 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.342463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1389  aminotransferase class V  43.2 
 
 
491 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0634  aminotransferase class V  36.32 
 
 
421 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0398  tetrahydrodipicolinate N-succinyltransferase  36.45 
 
 
442 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0593  conserved hypothetical protein, putative NifS-like aminotransferase  32.63 
 
 
421 aa  249  1e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000269729  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1221  aminotransferase, putative  33.1 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1236  putative aminotransferase  32.86 
 
 
426 aa  234  3e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0882  aminotransferase, putative  32.86 
 
 
422 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0214  putative aminotransferase  33.96 
 
 
441 aa  234  4.0000000000000004e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0812  aminotransferase, putative  32.86 
 
 
422 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.4562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0080  putative aminotransferase  32.27 
 
 
433 aa  224  2e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0692072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0160  putative aminotransferase  31.83 
 
 
442 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20010  Cysteine desulfurase  32.43 
 
 
442 aa  200  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000584034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2656  Cysteine desulfurase  31.38 
 
 
501 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.596375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0811  Cysteine desulfurase  33.41 
 
 
452 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.13 
 
 
406 aa  153  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  31.2 
 
 
406 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2429  cysteine desulfurase  31.14 
 
 
470 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1720  aminotransferase, class V  26.27 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.116446  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1448  aminotransferase, class V  26.27 
 
 
428 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.457541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0201  aminotransferase, class V  25.32 
 
 
485 aa  145  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0048  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.47 
 
 
413 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0653  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.46 
 
 
408 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  28.23 
 
 
406 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  26.07 
 
 
408 aa  137  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  28.23 
 
 
406 aa  137  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  28.23 
 
 
406 aa  137  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  28.8 
 
 
413 aa  136  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  28.23 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  29.84 
 
 
410 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.23 
 
 
406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.42 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.42 
 
 
413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.97 
 
 
406 aa  134  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.91 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2054  aminotransferase, class V  29.86 
 
 
880 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.754406 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.38 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2219  phosphoadenosine phosphosulfate reductase  29.33 
 
 
885 aa  127  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.911418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  30.13 
 
 
416 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.28 
 
 
417 aa  127  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2091  cysteine desulfurase, SufS subfamily  32.02 
 
 
419 aa  126  9e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000201738 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  31.82 
 
 
414 aa  125  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2006  cysteine desulphurases, SufS  28.83 
 
 
395 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.66 
 
 
414 aa  125  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  30.99 
 
 
420 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.16 
 
 
409 aa  124  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  28.65 
 
 
414 aa  124  5e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2068  aminotransferase, class V  28.24 
 
 
392 aa  124  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.17 
 
 
413 aa  124  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  26.27 
 
 
404 aa  123  9e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  28.2 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.44 
 
 
406 aa  123  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  28.2 
 
 
414 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  27.94 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0729  NifS protein  28.1 
 
 
393 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.26 
 
 
414 aa  121  3.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0949  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.35 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.286124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3281  cysteine desulfurase, SufS subfamily  30.71 
 
 
429 aa  120  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.30955  normal  0.0478783 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2844  cysteine desulfurase  27.84 
 
 
460 aa  120  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1512  aminotransferase class V  28.21 
 
 
896 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0374099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1041  aminotransferase, class V  29.7 
 
 
878 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31514  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  30.29 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.9 
 
 
672 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0228689 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  27.39 
 
 
405 aa  119  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  29.77 
 
 
410 aa  118  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.1 
 
 
418 aa  118  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1338  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.9 
 
 
674 aa  118  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.986463 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.86 
 
 
413 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  31.11 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  29.03 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  27.94 
 
 
413 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1112  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  28.33 
 
 
417 aa  116  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.966588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0101  SufS subfamily cysteine desulfurase  28.23 
 
 
414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.724967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  26.65 
 
 
420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  29.98 
 
 
451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  30 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1549  cysteine desulfurase, SufS subfamily  28.64 
 
 
673 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0186902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  29.32 
 
 
418 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>