More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3490 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  79.34 
 
 
460 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  97.15 
 
 
456 aa  811    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
456 aa  874    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  99.34 
 
 
456 aa  870    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.12 
 
 
465 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.43 
 
 
496 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.5 
 
 
491 aa  379  1e-104  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.28 
 
 
507 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  47.28 
 
 
494 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.68 
 
 
506 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.35 
 
 
517 aa  359  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.31 
 
 
515 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  47.38 
 
 
484 aa  353  5e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.25 
 
 
490 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  48.11 
 
 
488 aa  351  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.32 
 
 
475 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  45.32 
 
 
487 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  45.47 
 
 
488 aa  347  3e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  46.27 
 
 
491 aa  347  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.55 
 
 
490 aa  343  4e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.59 
 
 
463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  45.41 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.61 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.51 
 
 
491 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.43 
 
 
480 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  44.74 
 
 
461 aa  323  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  41.93 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.03 
 
 
479 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.7 
 
 
483 aa  317  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.38 
 
 
440 aa  316  6e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.83 
 
 
433 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.29 
 
 
518 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.59 
 
 
438 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.93 
 
 
521 aa  309  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.42 
 
 
463 aa  309  6.999999999999999e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.35 
 
 
498 aa  309  6.999999999999999e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  45.67 
 
 
452 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.27 
 
 
470 aa  307  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  42.44 
 
 
502 aa  305  9.000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.28 
 
 
484 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  44.3 
 
 
453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.51 
 
 
462 aa  303  4.0000000000000003e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.13 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.26 
 
 
460 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.13 
 
 
437 aa  299  7e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.66 
 
 
442 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.72 
 
 
441 aa  297  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.03 
 
 
471 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.33 
 
 
438 aa  297  3e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.81 
 
 
471 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.81 
 
 
471 aa  296  4e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.89 
 
 
480 aa  296  5e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0362  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.39 
 
 
452 aa  296  7e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00525533  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
466 aa  296  7e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2372  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.11 
 
 
457 aa  296  7e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  40.67 
 
 
442 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.44 
 
 
442 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  40.44 
 
 
442 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  41.53 
 
 
430 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  43.32 
 
 
470 aa  292  7e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  41.03 
 
 
445 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.61 
 
 
445 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  40.85 
 
 
428 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  41.03 
 
 
445 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  41.03 
 
 
445 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3962  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.32 
 
 
446 aa  290  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1240  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 
471 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  41.03 
 
 
445 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.14 
 
 
454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.92 
 
 
470 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  40.92 
 
 
448 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  41.74 
 
 
429 aa  289  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.5 
 
 
444 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  41.15 
 
 
470 aa  289  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.5 
 
 
444 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.39 
 
 
431 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3669  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.11 
 
 
446 aa  288  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.07 
 
 
445 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  40.92 
 
 
470 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.33 
 
 
441 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  40.05 
 
 
444 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.65 
 
 
461 aa  286  4e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3956  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.79 
 
 
449 aa  286  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550955  normal  0.250278 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  40.05 
 
 
444 aa  286  4e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4595  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.49 
 
 
445 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.65 
 
 
442 aa  286  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4143  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.84 
 
 
446 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4275  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.4 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.77 
 
 
429 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  42.03 
 
 
434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.35 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  42.53 
 
 
496 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.16 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40 
 
 
436 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0429  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.11 
 
 
435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.5 
 
 
434 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.5 
 
 
434 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  40.31 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1827  xanthine/uracil permease family protein  39.11 
 
 
429 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>