63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3451 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3451  protein of unknown function DUF52  100 
 
 
299 aa  570  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3387  protein of unknown function DUF52  98.33 
 
 
299 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3308  hypothetical protein  92.95 
 
 
301 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3629  hypothetical protein  42.52 
 
 
405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3955  hypothetical protein  42.75 
 
 
405 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0075  hypothetical protein  35.09 
 
 
414 aa  133  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000235956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1422  hypothetical protein  29.04 
 
 
265 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00741798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2394  hypothetical protein  33.84 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00099938  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1383  hypothetical protein  26.69 
 
 
284 aa  79  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1298  hypothetical protein  31.93 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.495257  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0273  hypothetical protein  29.07 
 
 
287 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0215  hypothetical protein  23.86 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2377  protein of unknown function DUF52  32.66 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0146872  normal  0.265283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1088  hypothetical protein  21.95 
 
 
274 aa  63.5  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1264  hypothetical protein  22.22 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000472011  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2409  hypothetical protein  32.84 
 
 
284 aa  63.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.156274  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0897  hypothetical protein  29.52 
 
 
278 aa  62.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0477  hypothetical protein  31.66 
 
 
269 aa  62.8  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2620  hypothetical protein  26.2 
 
 
282 aa  62.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.568978 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1301  protein of unknown function DUF52  25 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0694479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2139  hypothetical protein  24.15 
 
 
282 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000979295  hitchhiker  0.0000710104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0398  hypothetical protein  28.57 
 
 
274 aa  61.6  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1971  hypothetical protein  30.39 
 
 
267 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307446 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1046  protein of unknown function DUF52  21.51 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.491451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1996  AMMECR1 domain-containing protein  26.9 
 
 
522 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0448  hypothetical protein  33.76 
 
 
282 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2994  protein of unknown function DUF52  29.04 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.255109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1928  protein of unknown function DUF52  29.86 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46220  predicted protein  22.97 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0715961  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2214  hypothetical protein  28.28 
 
 
262 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0632  hypothetical protein  23.16 
 
 
284 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.339724 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1286  hypothetical protein  22.11 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1177  hypothetical protein  24.63 
 
 
447 aa  55.8  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0272  protein of unknown function DUF52  25.49 
 
 
287 aa  55.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00648873  hitchhiker  0.000150956 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1586  hypothetical protein  31.82 
 
 
464 aa  55.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.251003  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2683  hypothetical protein  27.65 
 
 
274 aa  55.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.235336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1326  protein of unknown function DUF52  30.65 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0115608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1651  dioxygenase  26.64 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.23672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3068  hypothetical protein  31.88 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.27957  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1171  hypothetical protein  24.63 
 
 
447 aa  54.7  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0726  protein of unknown function DUF52  30.1 
 
 
282 aa  53.5  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.14688  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0191  hypothetical protein  23.16 
 
 
284 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.528017  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0697  hypothetical protein  24.07 
 
 
284 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0680  hypothetical protein  26.64 
 
 
279 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2215  protein of unknown function DUF52  30.3 
 
 
274 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1691  hypothetical protein  31.16 
 
 
267 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2295  protein of unknown function DUF52  29.14 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03789  DUF52 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03970)  27.91 
 
 
366 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3293  protein of unknown function DUF52  28.63 
 
 
274 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1590  hypothetical protein  22.66 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0931  hypothetical protein  28.64 
 
 
266 aa  49.3  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2961  hypothetical protein  30.34 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1811  hypothetical protein  25.62 
 
 
262 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2152  hypothetical protein  30.86 
 
 
481 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1509  protein of unknown function DUF52  24.13 
 
 
269 aa  46.6  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1871  hypothetical protein  34.57 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0572  hypothetical protein  29.08 
 
 
264 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.277433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1004  hypothetical protein  26.38 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1830  hypothetical protein  29.62 
 
 
267 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3359  hypothetical protein  28.28 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0072  hypothetical protein  26.9 
 
 
267 aa  43.1  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0180  protein of unknown function DUF52  25.93 
 
 
285 aa  43.1  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.578209  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1885  protein of unknown function DUF52  27.45 
 
 
267 aa  42.4  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00286837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>