26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3436 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  555  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  52.16 
 
 
270 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  49.66 
 
 
313 aa  258  6e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  55.65 
 
 
321 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  66.13 
 
 
316 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  60.31 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  65.91 
 
 
319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  64.77 
 
 
316 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  65.34 
 
 
319 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  46.91 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  39.81 
 
 
165 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  33.08 
 
 
165 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  25.36 
 
 
288 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  32.14 
 
 
188 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  20.94 
 
 
255 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  29.48 
 
 
203 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  29.21 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  30.17 
 
 
213 aa  49.3  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  25.88 
 
 
188 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000377569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  36 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  30.25 
 
 
195 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  32.1 
 
 
174 aa  45.8  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000542792  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  26.09 
 
 
267 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  28.75 
 
 
189 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  28.3 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  36.62 
 
 
202 aa  42.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>