48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3424 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3424  protein of unknown function DUF114  100 
 
 
339 aa  703    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3471  protein of unknown function DUF114  42.77 
 
 
296 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3346  protein of unknown function DUF114  29.81 
 
 
258 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4091  hypothetical protein  27.92 
 
 
293 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11070  periplasmic serine protease (ClpP class)  39.08 
 
 
265 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000898783  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2297  protein of unknown function DUF114  39.08 
 
 
286 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0558  protein of unknown function DUF114  32.52 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0335  hypothetical protein  34.15 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0491521  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3527  protein of unknown function DUF114  33.07 
 
 
275 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7800  hypothetical protein  36.96 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.842137  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0215  protein of unknown function DUF114  30.2 
 
 
278 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0321874  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1401  protein of unknown function DUF114  36.26 
 
 
277 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.129163  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03440  periplasmic serine protease (ClpP class)  36.78 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3319  hypothetical protein  36.96 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2861  protein of unknown function DUF114  28.12 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0202  protein of unknown function DUF114  29.56 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1334  protein of unknown function DUF114  36.78 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.611057  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1198  hypothetical protein  34.88 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2943  hypothetical protein  34.78 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0056563 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3097  hypothetical protein  34.78 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.645048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0011  hypothetical protein  30.89 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1874  hypothetical protein  39.08 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.923248  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0011  hypothetical protein  30.89 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1020  hypothetical protein  32.97 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1661  hypothetical protein  32.97 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0926  hypothetical protein  32.97 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4766  protein of unknown function DUF114  37.93 
 
 
296 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0583634  hitchhiker  0.000468876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0678  hypothetical protein  28.05 
 
 
279 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1139  hypothetical protein  32.61 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1233  hypothetical protein  33.64 
 
 
292 aa  67.4  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.17311  normal  0.434623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1781  hypothetical protein  35.63 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1552  hypothetical protein  35.63 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238673 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0404  protein of unknown function DUF114  43.94 
 
 
280 aa  65.5  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1299  protein of unknown function DUF114  36.78 
 
 
277 aa  64.7  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.856082  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0381  hypothetical protein  32.61 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.824542  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1537  hypothetical protein  37.21 
 
 
301 aa  63.5  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.675779  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2712  protein of unknown function DUF114  28.46 
 
 
269 aa  63.2  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0940  hypothetical protein  25.46 
 
 
330 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0878  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000902689  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3600  hypothetical protein  35 
 
 
272 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.354038  normal  0.0141904 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3172  protein of unknown function DUF114  26.98 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.601853  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2773  hypothetical protein  31.87 
 
 
323 aa  52  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1836  hypothetical protein  22.95 
 
 
354 aa  48.5  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3727  hypothetical protein  35.21 
 
 
354 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.175021  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1629  R2.LlaJI  24.15 
 
 
349 aa  47.4  0.0004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0248162  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  22.12 
 
 
547 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4353  peptidase S14 ClpP  36.36 
 
 
620 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26326  hitchhiker  0.00986992 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4681  hypothetical protein  33.33 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>