41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3359 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  100 
 
 
270 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  95.19 
 
 
270 aa  495  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3285  ABC-2 type transporter  97.41 
 
 
270 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  71.8 
 
 
269 aa  352  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  37.56 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0127  ABC-2 transporter component  35.91 
 
 
282 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177807  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0128  hypothetical protein  36.15 
 
 
276 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.474534  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  37.09 
 
 
276 aa  135  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2239  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.627796  normal  0.0598095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0062  hypothetical protein  35.21 
 
 
276 aa  135  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7657  putative ABC transporter, permease protein  35.48 
 
 
270 aa  132  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868338  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0434  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 
266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2789  ABC-2 type transporter  25.38 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 
286 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0666  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 
262 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.700678  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  24.73 
 
 
286 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.68 
 
 
253 aa  46.6  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  27.8 
 
 
268 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
270 aa  45.4  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1716  ABC transporter, inner membrane subunit  25.23 
 
 
263 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2458  ABC transporter  28.16 
 
 
285 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504776  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1595  ABC transporter  28.96 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333658  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1115  ABC transporter  28.96 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2296  ABC-2 type transporter, NodJ  26.74 
 
 
289 aa  42.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 
308 aa  42.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1767  ABC-2 type transporter, NodJ family  28.9 
 
 
275 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  27.22 
 
 
277 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1635  ABC transporter  28.66 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  0.731172 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1572  ABC transporter  28.96 
 
 
277 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  23.86 
 
 
253 aa  42.4  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2476  ligolipopolysacharide ABC exporter inner membrane subunit NodJ family protein  28.9 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.631988  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 
384 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>