More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3299 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3299  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
306 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  97.25 
 
 
306 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  94.85 
 
 
316 aa  517  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  48.4 
 
 
342 aa  267  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  44.87 
 
 
388 aa  265  5.999999999999999e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  48.9 
 
 
323 aa  262  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  44.55 
 
 
329 aa  259  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  46.06 
 
 
318 aa  253  4.0000000000000004e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  44.44 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  45.74 
 
 
323 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  45.66 
 
 
376 aa  242  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  43.56 
 
 
340 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  40.95 
 
 
340 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  39.42 
 
 
345 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  42.54 
 
 
343 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  42.54 
 
 
343 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  40.38 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  39.1 
 
 
340 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  41.64 
 
 
356 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  40.66 
 
 
319 aa  209  5e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  43.93 
 
 
453 aa  209  6e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.9 
 
 
341 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  41.77 
 
 
341 aa  206  5e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  42.09 
 
 
341 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  41.9 
 
 
342 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  42.59 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  42.31 
 
 
339 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  42.09 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4304  hypothetical protein  42.07 
 
 
325 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  42.09 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  41.77 
 
 
342 aa  203  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  42.04 
 
 
338 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  41.77 
 
 
341 aa  202  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  42.01 
 
 
343 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  42.01 
 
 
343 aa  201  9e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  41.77 
 
 
341 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  57.76 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  42.49 
 
 
331 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2618  hypothetical protein  41.72 
 
 
334 aa  197  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  43 
 
 
313 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  42.54 
 
 
343 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  43.56 
 
 
334 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  43.77 
 
 
326 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  41.72 
 
 
337 aa  194  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  43.41 
 
 
329 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  37.82 
 
 
357 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  42.27 
 
 
315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3933  hypothetical protein  41.35 
 
 
327 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00672502 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  42.41 
 
 
333 aa  189  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  44.28 
 
 
360 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  43.71 
 
 
340 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  40.79 
 
 
357 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  42.47 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1935  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  57.59 
 
 
176 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000282048  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2293  hypothetical protein  39.43 
 
 
339 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  38.07 
 
 
390 aa  178  8e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  37.25 
 
 
385 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2836  hypothetical protein  39.43 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.241522  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1599  protein of unknown function DUF182  38.87 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35530  hypothetical protein  38.51 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  39.42 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1908  hypothetical protein  37.99 
 
 
323 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.411944  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2902  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.48 
 
 
250 aa  170  3e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.977252  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4011  hypothetical protein  39.87 
 
 
360 aa  169  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0739475  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  36.54 
 
 
386 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  36.54 
 
 
386 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  36.54 
 
 
386 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  38.22 
 
 
323 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  38.22 
 
 
323 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  38.34 
 
 
368 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  35.87 
 
 
364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0866  hypothetical protein  40.58 
 
 
342 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3797  hypothetical protein  37.99 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.410951  normal  0.629316 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3585  hypothetical protein  37.42 
 
 
320 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  43.81 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  36.36 
 
 
329 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1633  hypothetical protein  37.99 
 
 
323 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3673  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.19 
 
 
233 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0474  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  56.33 
 
 
228 aa  160  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0496449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5313  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  48.8 
 
 
233 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.377214 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5448  xanthine dehydrogenase accessory factor  55.09 
 
 
228 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.87643  normal  0.175638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4231  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  37.66 
 
 
323 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.13005  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0531  hypothetical protein  38.85 
 
 
323 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.916734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1787  xanthine dehydrogenase accessory factor  47.27 
 
 
233 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.112917  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.72 
 
 
242 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  37.43 
 
 
374 aa  158  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4321  hypothetical protein  43.72 
 
 
233 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1636  xanthine dehydrogenase accessory factor  43.78 
 
 
230 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.215395  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1755  xanthine dehydrogenase accessory factor  50.89 
 
 
242 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0970  hypothetical protein  51.74 
 
 
216 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2602  hypothetical protein  46.67 
 
 
230 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2391  hypothetical protein  36.39 
 
 
322 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0816384  normal  0.376452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0986  xanthine dehydrogenase accessory factor  50 
 
 
243 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.044104  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2657  xanthine dehydrogenase accessory factor XdhC, putative  37.14 
 
 
322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.158327  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2200  hypothetical protein  46.99 
 
 
230 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3910  xanthine dehydrogenase accessory factor  44.12 
 
 
234 aa  153  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3469  xanthine dehydrogenase accessory factor  49.13 
 
 
233 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.386944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  37.77 
 
 
370 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4534  hypothetical protein  34.73 
 
 
387 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1056  xanthine dehydrogenase accessory factor  48.78 
 
 
242 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>