20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3182 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2984  peptidase M48, Ste24p  95.15 
 
 		 495 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.37325  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3182  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 495 aa  909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.206612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3081  peptidase M48, Ste24p  98.59 
 
 		 495 aa  896    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.264876  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1032  peptidase M48, Ste24p  27.01 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0108936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2740  peptidase M48, Ste24p  29.94 
 
 		 510 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0437  peptidase M48 Ste24p  31 
 
 		 503 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3140  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 		 623 aa  79  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0822769  hitchhiker  0.000295634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1714  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 		 708 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.729234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7083  Zn-dependent protease with chaperone function-like protein  24.54 
 
 		 713 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3604  hypothetical protein  29.68 
 
 		 773 aa  60.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0522431  hitchhiker  0.00718988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0490  Zn-dependent protease with chaperone function  26.01 
 
 		 615 aa  60.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35050  hypothetical protein  33.89 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00854172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3197  Zn-dependent protease with chaperone function-like  26.76 
 
 		 634 aa  57  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000540143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 485 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.188769  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3388  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 		 645 aa  49.7  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.247321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2726  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 		 623 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0179908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1278  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 		 617 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8783  peptidase M48 Ste24p  28.18 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  25.22 
 
 		 279 aa  44.3  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3806  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 620 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>