More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3168 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3060  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.36 
 
 
424 aa  644    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3168  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
430 aa  835    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2972  secretion protein HlyD  96.05 
 
 
429 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2203  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.12 
 
 
419 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.12 
 
 
419 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000305818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0496  RND family efflux transporter MFP subunit  51.03 
 
 
402 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3038  secretion protein HlyD  48.15 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167095  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1129  RND family efflux transporter MFP subunit  49.23 
 
 
407 aa  325  7e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3233  RND family efflux transporter MFP subunit  48.22 
 
 
405 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000196171  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3595  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.03 
 
 
404 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0852698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1166  secretion protein HlyD  42.05 
 
 
412 aa  276  6e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.912906  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0307  RND family efflux transporter MFP subunit  44.39 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0899354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1892  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 
430 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1814  RND family efflux transporter MFP subunit  37.89 
 
 
432 aa  258  2e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1726  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.22 
 
 
395 aa  256  6e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000359698  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2777  RND family efflux transporter MFP subunit  43.59 
 
 
489 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000975793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  39.09 
 
 
429 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1178  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 
390 aa  253  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2811  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 
444 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3643  RND family efflux transporter MFP subunit  39.11 
 
 
455 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.384349  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1414  secretion protein HlyD  40 
 
 
430 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1706  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.69 
 
 
430 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.353178  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  43.44 
 
 
493 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 
419 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.321445  normal  0.921537 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0782  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 
428 aa  232  1e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00204407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3127  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 
416 aa  229  1e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3375  HlyD family membrane fusion protein  41.44 
 
 
425 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3021  RND family efflux transporter MFP subunit  41.44 
 
 
418 aa  227  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0354964  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.58 
 
 
409 aa  223  7e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3864  ABC transporter related  41.07 
 
 
418 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.606554  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3548  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489121  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2041  secretion protein HlyD  35.06 
 
 
398 aa  218  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3918  secretion protein HlyD  39.42 
 
 
433 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3605  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.26 
 
 
429 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2151  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 
471 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.563694  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0815  membrane-fusion protein  37.17 
 
 
434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 
466 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2825  Fis family transcriptional regulator  37.96 
 
 
466 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506795  normal  0.45265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3185  secretion protein HlyD  36.21 
 
 
446 aa  210  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0906  secretion protein HlyD  33.89 
 
 
449 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.101628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.85 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2037  secretion protein HlyD  32.78 
 
 
446 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.35853  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0365  membrane-fusion protein  37.82 
 
 
394 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3707  RND family efflux transporter MFP subunit  37.25 
 
 
437 aa  183  7e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00914113 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1617  secretion protein HlyD  37.26 
 
 
408 aa  176  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0160623  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1671  HlyD family secretion protein  36.89 
 
 
408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1259  RND family efflux transporter MFP subunit  32.51 
 
 
415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1101  RND family efflux transporter MFP subunit  36.54 
 
 
414 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.402678  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3523  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 
438 aa  162  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.51854  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  34.43 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  34.43 
 
 
370 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  34.1 
 
 
370 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1339  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 
384 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.611384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5132  RND family efflux transporter MFP subunit  38.01 
 
 
445 aa  150  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3721  putative membrane-fusion protein  35.53 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.45383  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0820  HlyD family secretion protein  31.55 
 
 
405 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0725  HlyD family secretion protein  32.42 
 
 
397 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.897812  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0795  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 
411 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  34.69 
 
 
371 aa  143  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3282  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 
410 aa  143  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.68571  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5333  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
397 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.037024 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0800  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
416 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000642362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3415  secretion protein HlyD  32.12 
 
 
397 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.89814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4953  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 
397 aa  143  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  normal  0.0662922 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0832  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
416 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000487508  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000019827  hitchhiker  0.00000000236896 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  32.74 
 
 
417 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4209  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 
392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122721  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2042  secretion protein HlyD  34.25 
 
 
414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.617858  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3536  RND family efflux transporter MFP subunit  30.14 
 
 
416 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.86 
 
 
409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000285815  normal  0.0164702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1334  secretion protein HlyD  29.27 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1791  macrolide efflux protein MacA  33.12 
 
 
420 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0927  macrolide efflux protein MacA  32.51 
 
 
399 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2186  macrolide efflux protein MacA  32.41 
 
 
428 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0836  macrolide efflux protein MacA  32.41 
 
 
435 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0404665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1670  macrolide transporter subunit MacA  35.15 
 
 
348 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  33.11 
 
 
385 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  26.33 
 
 
397 aa  138  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  33.89 
 
 
391 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33770  hypothetical protein  28.83 
 
 
391 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127582  hitchhiker  0.00383681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.04 
 
 
401 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.140784  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2317  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.788366  normal  0.425659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1059  macrolide transporter subunit MacA  33.44 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.75011  normal  0.992508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2871  hypothetical protein  28.83 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.518674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2831  syringolide efflux protein SyfC  32.11 
 
 
383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.580145  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1008  macrolide transporter subunit MacA  32.47 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.622007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3781  RND family efflux transporter MFP subunit  33.76 
 
 
407 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.35 
 
 
410 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3171  RND family efflux transporter MFP subunit  27.46 
 
 
416 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000224755  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.9 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  33.02 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.02 
 
 
371 aa  133  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0942  macrolide transporter subunit MacA  32.47 
 
 
372 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>