More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3088 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  98.82 
 
 
425 aa  849  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  100 
 
 
425 aa  860  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  94.35 
 
 
415 aa  802  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  76.84 
 
 
398 aa  617  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3910  acetate kinase  70.86 
 
 
411 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1591  acetate kinase  75.13 
 
 
396 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390767  normal  0.0967688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4009  acetate kinase  72.19 
 
 
411 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4051  acetate kinase  71.03 
 
 
411 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  50.13 
 
 
400 aa  399  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2393  acetate kinase  52.81 
 
 
398 aa  401  1e-110  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.451887  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  51.02 
 
 
399 aa  398  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  53.09 
 
 
398 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  50.63 
 
 
413 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  50 
 
 
399 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  50.25 
 
 
398 aa  391  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  5.57586e-07 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  50.25 
 
 
399 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  50 
 
 
400 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1669  acetate kinase  50.51 
 
 
398 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0184295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  50.9 
 
 
395 aa  383  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  49.74 
 
 
399 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.76936e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  49.74 
 
 
399 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  49.74 
 
 
399 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  50 
 
 
399 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  49.74 
 
 
399 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  50 
 
 
399 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  49.75 
 
 
399 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  52.32 
 
 
395 aa  377  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  49.24 
 
 
404 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1379  acetate kinase  51.28 
 
 
408 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.47 
 
 
397 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3644  acetate kinase  50.39 
 
 
394 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922288  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4098  propionate/acetate kinase  48.48 
 
 
403 aa  367  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3176  acetate kinase  46.94 
 
 
412 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  47.12 
 
 
398 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.54307e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2998  acetate kinase  51.15 
 
 
405 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  47.06 
 
 
393 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  47.97 
 
 
396 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  48.24 
 
 
395 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  2.37028e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41120  acetate kinase  51.04 
 
 
399 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0461537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  45.23 
 
 
398 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0833  acetate kinase  52.96 
 
 
414 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528826  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2006  acetate kinase  52.96 
 
 
414 aa  359  5e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.479503  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  47.69 
 
 
398 aa  359  5e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1078  acetate kinase  52.96 
 
 
414 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.458845  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0616  acetate kinase  46.58 
 
 
398 aa  357  2e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.781931  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.25 
 
 
399 aa  356  4e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.59685e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  45.94 
 
 
397 aa  355  9e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3562  propionate/acetate kinase  48.22 
 
 
402 aa  353  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1551  acetate kinase  48.25 
 
 
400 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.099889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1443  acetate kinase  48.25 
 
 
400 aa  353  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1825  acetate kinase  48.25 
 
 
400 aa  353  2e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  45.94 
 
 
397 aa  353  3e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  43.89 
 
 
404 aa  353  3e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  44.61 
 
 
398 aa  353  3e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  47.79 
 
 
394 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  44.61 
 
 
398 aa  353  4e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3433  propionate/acetate kinase  46.75 
 
 
402 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3537  propionate/acetate kinase  46.75 
 
 
402 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.831906  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3600  propionate/acetate kinase  46.75 
 
 
402 aa  352  8e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.941292  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  46.87 
 
 
406 aa  352  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3504  propionate/acetate kinase  46.5 
 
 
402 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3430  propionate/acetate kinase  46.75 
 
 
402 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  47.79 
 
 
394 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  47.36 
 
 
401 aa  350  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.22881e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  43.83 
 
 
401 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0642  acetate kinase  49.24 
 
 
449 aa  350  4e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0994  acetate kinase  46.33 
 
 
397 aa  348  1e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  9.48202e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  45.77 
 
 
403 aa  347  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  47.97 
 
 
401 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0856  acetate kinase  49.62 
 
 
409 aa  347  3e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00408014  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  45.77 
 
 
403 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  44.36 
 
 
396 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  46.12 
 
 
406 aa  347  3e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  45.39 
 
 
399 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001527  acetate kinase  45.04 
 
 
397 aa  346  4e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3316  acetate kinase  48 
 
 
400 aa  345  7e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00011444  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  45.23 
 
 
398 aa  345  8e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  44.25 
 
 
398 aa  344  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2309  acetate kinase  44.78 
 
 
396 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2112  acetate kinase  45.55 
 
 
398 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0121493  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  45.52 
 
 
398 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0923  acetate kinase  45.92 
 
 
421 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002968  acetate kinase  45.55 
 
 
398 aa  342  5e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  45.86 
 
 
402 aa  342  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0583  propionate/acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  342  6e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3589  propionate/acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  342  7e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.916752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0588  acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  342  8e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3303  propionate/acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  342  8e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.307488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02933  hypothetical protein  47.55 
 
 
406 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2840  acetate kinase  47.21 
 
 
400 aa  342  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.546622 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02982  propionate kinase/acetate kinase C, anaerobic  47.55 
 
 
406 aa  342  1e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3411  propionate/acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  45.18 
 
 
398 aa  340  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3242  propionate/acetate kinase  47.55 
 
 
402 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4428  propionate/acetate kinase  47.29 
 
 
402 aa  339  6e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0208256 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  44.91 
 
 
408 aa  338  8e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  1.79563e-09  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1385  acetate kinase  46.95 
 
 
400 aa  338  9e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00164511  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0803  acetate kinase  45.43 
 
 
398 aa  338  1e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102321  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  44 
 
 
399 aa  338  1e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.13101e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  42.89 
 
 
397 aa  338  1e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>