More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3085 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
205 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  96.1 
 
 
205 aa  352  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  86.7 
 
 
205 aa  343  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  76.21 
 
 
251 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  48.75 
 
 
205 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  48.77 
 
 
227 aa  118  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  48.1 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  47.1 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  46.63 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  45.08 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  46.63 
 
 
229 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  46.63 
 
 
229 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  46.58 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  46.58 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 
220 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 
220 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  46.58 
 
 
220 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 
230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  41.25 
 
 
214 aa  106  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  43.45 
 
 
240 aa  105  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  43.01 
 
 
197 aa  105  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 
209 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
188 aa  104  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  41.01 
 
 
223 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  46.84 
 
 
223 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
221 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 
220 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 
224 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
221 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 
221 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  41.97 
 
 
197 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  47.37 
 
 
215 aa  102  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  42.01 
 
 
225 aa  102  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  44.94 
 
 
227 aa  102  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 
224 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  49.36 
 
 
224 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.01 
 
 
378 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  43.26 
 
 
220 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  45.73 
 
 
220 aa  102  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  41.33 
 
 
220 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.9 
 
 
369 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 
218 aa  101  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  44.31 
 
 
237 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.01 
 
 
378 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.87 
 
 
442 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
411 aa  100  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
209 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  40.31 
 
 
199 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.03 
 
 
442 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 
194 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  42.56 
 
 
243 aa  99.8  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  42.94 
 
 
202 aa  99  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  41.61 
 
 
214 aa  98.6  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.77 
 
 
209 aa  98.2  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  40 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 
206 aa  98.2  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  47.47 
 
 
223 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  37.42 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
213 aa  97.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 
197 aa  97.8  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  42.01 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  44.44 
 
 
210 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  43.71 
 
 
196 aa  95.9  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.29 
 
 
197 aa  95.9  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  44.23 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  44.23 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
201 aa  95.9  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 
220 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 
224 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  42.04 
 
 
212 aa  94.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  41.67 
 
 
223 aa  94.7  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  38.54 
 
 
197 aa  94.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 
212 aa  94.7  9e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.07 
 
 
356 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.88 
 
 
443 aa  93.2  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  41.18 
 
 
382 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 
198 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  36.32 
 
 
203 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  40.7 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  48.74 
 
 
440 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.2 
 
 
365 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.2 
 
 
365 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.2 
 
 
365 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  41.61 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  41.62 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
225 aa  92  5e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
215 aa  91.3  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>