More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3055 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  100 
 
 		 950 aa  1941    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  37.87 
 
 		 995 aa  617  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  34.32 
 
 		 1036 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  41.29 
 
 		 1058 aa  515  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  26.3 
 
 		 1020 aa  317  7e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  32.59 
 
 		 836 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  27.26 
 
 		 795 aa  197  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  27.59 
 
 		 404 aa  174  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  24.73 
 
 		 974 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  27.36 
 
 		 684 aa  129  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1177 aa  122  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  22.37 
 
 		 1076 aa  121  7e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  27.05 
 
 		 416 aa  119  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  23.94 
 
 		 1120 aa  115  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  28.78 
 
 		 1041 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  37.3 
 
 		 792 aa  114  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  23.11 
 
 		 410 aa  113  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  23.05 
 
 		 1154 aa  104  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2617  N-6 DNA methylase  23.88 
 
 		 673 aa  102  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2211  hypothetical protein  37.12 
 
 		 162 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00033176  normal  0.0601235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  23.53 
 
 		 1170 aa  99.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  26.51 
 
 		 1426 aa  95.9  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1178 aa  96.3  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1125 aa  95.5  5e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0162  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1016 aa  94.7  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3141  N-6 DNA methylase  23.02 
 
 		 746 aa  92.4  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1147 aa  92  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1195 aa  91.3  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6570  hypothetical protein  27.67 
 
 		 926 aa  90.9  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1469  type I restriction-modification system, M subunit, putative  21.86 
 
 		 1002 aa  90.1  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1218 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  25.83 
 
 		 1189 aa  86.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0121  putative DNA methylase  22.7 
 
 		 1022 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  23.06 
 
 		 1186 aa  85.5  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1612 aa  85.5  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1209 aa  85.5  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  25.5 
 
 		 1219 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1338 aa  84.7  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  20.6 
 
 		 1144 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  21.76 
 
 		 1194 aa  81.6  0.00000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  27.71 
 
 		 1159 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  27.97 
 
 		 816 aa  79.7  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  25.78 
 
 		 1222 aa  79  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2355  N-6 DNA methylase  24.64 
 
 		 1038 aa  79  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0792  hypothetical protein  24.2 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  21.72 
 
 		 694 aa  77  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  22.29 
 
 		 1257 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2384  hypothetical protein  28.08 
 
 		 732 aa  77  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  22.69 
 
 		 1244 aa  76.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  19.71 
 
 		 1039 aa  76.3  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1131 aa  76.3  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  24.84 
 
 		 1231 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  35.26 
 
 		 1432 aa  75.5  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1174  N-6 DNA methylase  26.54 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0879909  normal  0.322631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  25.9 
 
 		 1160 aa  74.7  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  25.06 
 
 		 1167 aa  74.3  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1338 aa  74.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0993  hypothetical protein  23.06 
 
 		 826 aa  73.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  25.91 
 
 		 775 aa  73.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  29.19 
 
 		 1055 aa  73.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  23.14 
 
 		 1104 aa  72.4  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  22.88 
 
 		 1209 aa  72  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  25.99 
 
 		 570 aa  70.5  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  23.9 
 
 		 612 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1182 aa  70.5  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  24.73 
 
 		 554 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1282 aa  70.5  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 		 527 aa  69.3  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2876  N-6 DNA methylase  23.49 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2728  putative DNA methylase  26.15 
 
 		 1208 aa  67.8  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1501  hypothetical protein  24.8 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1422 aa  67.8  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  26.67 
 
 		 553 aa  67.8  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  29.32 
 
 		 1256 aa  67.8  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1169  N-6 DNA methylase  23.92 
 
 		 499 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.337809  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 553 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1233 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  24 
 
 		 1132 aa  67  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  32.87 
 
 		 1298 aa  67  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0161  N-6 DNA methylase  27.12 
 
 		 508 aa  67  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.33 
 
 		 1134 aa  67  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  31.16 
 
 		 1299 aa  66.6  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  23.89 
 
 		 544 aa  67  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2914  N-6 DNA methylase  22.05 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170964  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  23.91 
 
 		 882 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  23.57 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  23.97 
 
 		 1183 aa  65.1  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2592  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1339 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.565404  hitchhiker  0.000489463 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0748  N-6 DNA methylase  24.76 
 
 		 504 aa  65.1  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000203871 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4361  N-6 DNA methylase  22.01 
 
 		 908 aa  65.1  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  23.2 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0217  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2889  N-6 DNA methylase  23.67 
 
 		 578 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2592  hypothetical protein  21.43 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  23.12 
 
 		 1270 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  28 
 
 		 1321 aa  64.3  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3845  DNA modification methyltransferase-related protein  23.42 
 
 		 978 aa  63.9  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0841462  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0993  Eco57I restriction endonuclease  22.92 
 
 		 595 aa  63.9  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.544878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1324 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1250 aa  63.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>