33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3043 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
146 aa  271  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  98.63 
 
 
146 aa  267  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  97.26 
 
 
146 aa  266  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  73.79 
 
 
147 aa  206  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  28.37 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  34.97 
 
 
152 aa  73.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  37.5 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  30 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  33.8 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  38.17 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.5 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  28.99 
 
 
158 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  34.48 
 
 
152 aa  60.8  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  30.34 
 
 
181 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  32.52 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  33.58 
 
 
180 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  25 
 
 
178 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  36.8 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  30 
 
 
148 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 
160 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  31.39 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  35.38 
 
 
171 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  28.36 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  33.55 
 
 
181 aa  43.9  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  31.45 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 
166 aa  41.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  23.42 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>