89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3005 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3005  TadE family protein  100 
 
 
140 aa  282  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3970  TadE family protein  55.26 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.043722  normal  0.677829 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2829  TadE-like  66.67 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.891584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2917  TadE family protein  69.81 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354094  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4440  TadE family protein  34.65 
 
 
126 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0344205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1165  TadE family protein  58.33 
 
 
143 aa  63.5  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0463265  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5407  TadE-like  41.18 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  26.98 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0798  hypothetical protein  37.5 
 
 
156 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0542  TadE family protein  37.5 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0422176  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0658  hypothetical protein  43.1 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0921771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2112  TadE family protein  38.27 
 
 
137 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1749  Flp pilus assembly protein TadG  34.33 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3428  TadE family protein  37.04 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.059057  normal  0.388912 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3935  TadE family protein  37.04 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0926444  normal  0.0826596 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1164  TadE family protein  32.88 
 
 
135 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.167453  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1651  TadE family protein  45.16 
 
 
165 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257032  normal  0.635162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  32.76 
 
 
209 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5858  TadE family protein  45.45 
 
 
153 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0252169  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3652  putative tight adherence (TadE/G) protein  37.19 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2050  TadE-like protein  32.91 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0057795  normal  0.0460537 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1673  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0329  TadE-like protein  31.71 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455203  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1880  TadE family protein  31.71 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.717439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1892  TadE family protein  31.71 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0832  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.384957  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2049  hypothetical protein  31.71 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0163426  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2929  TadE family protein  33.06 
 
 
129 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3426  TadE family protein  35.2 
 
 
132 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0764833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1050  TadE family protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1787  TadE family protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.972115  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2635  TadE family protein  28.89 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.857387 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1766  TadE family protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.586094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0115  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.583483  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  41.1 
 
 
170 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1780  TadE family protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1401  TadE family protein  33.04 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0415098  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1939  hypothetical protein  41.51 
 
 
155 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0225925  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2452  hypothetical protein  30.77 
 
 
142 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2800  putative transmembrane protein  45.9 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0675  TadE family protein  41.07 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1734  TadE family protein  36.19 
 
 
167 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0104166  hitchhiker  0.0000124491 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  42.31 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2544  hypothetical protein  42.31 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.307641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2226  TadE family protein  32.05 
 
 
131 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0718  TadE family protein  50 
 
 
187 aa  47.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1519  TadE family protein  44.9 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000188684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1039  TadE-like  44.9 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000150805  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1495  TadE family protein  44.9 
 
 
164 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514648  hitchhiker  0.0000117146 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4659  Flp pilus assembly protein TadG  44.9 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000790558  hitchhiker  0.00303362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  43.14 
 
 
162 aa  47  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1519  TadE-like  42 
 
 
177 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1441  TadE family protein  44.64 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.810829  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1495  TadE family protein  44.12 
 
 
160 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0078  TadE family protein  43.14 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413809  normal  0.991188 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1789  TadE-like  35.38 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4120  TadE family protein  39.34 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2369  hypothetical protein  51.16 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00453138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3515  TadE-like  40 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0396  TadE-like  45.65 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.385276  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3089  TadE-like protein  45.1 
 
 
153 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2536  TadE-like protein  39.47 
 
 
146 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2272  hypothetical protein  45.1 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292747  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0649  putative transmembrane protein  46.05 
 
 
144 aa  43.5  0.0009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.695052  normal  0.246018 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4452  TadE family protein  29.46 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  44.44 
 
 
147 aa  42.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  48.89 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3251  TadE family protein  60.61 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1024  TadE family protein  28.47 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2152  TadE-like  40.91 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.975839  normal  0.0763338 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1314  hypothetical protein  46.81 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4196  TadE family protein  38.3 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2964  TadE-like protein  46.81 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1525  hypothetical protein  40 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0363  TadE family protein  35.19 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3707  TadE-like  42.55 
 
 
176 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0138  TadE family protein  55.17 
 
 
135 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0253  TadE family protein  33.93 
 
 
336 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148755  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4722  hypothetical protein  29.89 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.238789  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0397  TadE-like  55.56 
 
 
204 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1838  TadE family protein  33.33 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2644  TadE family protein  35.59 
 
 
124 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1310  TadE-like protein  34.21 
 
 
138 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0585  TadE family protein  38.3 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.786226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5904  TadE family protein  50 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781531  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  48.48 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  51.85 
 
 
144 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0306  Flp pilus assembly protein TadG  40 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7197  TadE-like protein  36.36 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0163564  normal  0.273639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>