103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2906 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2722  hypothetical protein  98.24 
 
 
398 aa  773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2814  hypothetical protein  99.5 
 
 
398 aa  784    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0508779  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2906  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  787    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2714  hypothetical protein  74.69 
 
 
395 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0845  hypothetical protein  28.62 
 
 
273 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2798  hypothetical protein  29.1 
 
 
270 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0491439  normal  0.345027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2140  hypothetical protein  26.88 
 
 
273 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1731  hypothetical protein  26.86 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3768  hypothetical protein  31.18 
 
 
424 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0738  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
592 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0309  hypothetical protein  31.25 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0753  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
604 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3148  response regulator receiver protein  30.27 
 
 
567 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4184  hypothetical protein  29.08 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4157  hypothetical protein  28.72 
 
 
366 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2224  response regulator  36.84 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4041  hypothetical protein  27.88 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3946  hypothetical protein  32.75 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1728  response regulator receiver protein  33.66 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0387  hypothetical protein  28.74 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.527792  hitchhiker  0.000473152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1324  hypothetical protein  27.45 
 
 
428 aa  73.2  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.10293 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4056  hypothetical protein  32.16 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4089  hypothetical protein  32.16 
 
 
440 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0064  hypothetical protein  33.33 
 
 
898 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0231  hypothetical protein  32.95 
 
 
591 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.305258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1395  hypothetical protein  32.16 
 
 
600 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0261  response regulator receiver domain-containing protein  31.98 
 
 
581 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0296157  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2313  hypothetical protein  35.11 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2965  hypothetical protein  28.25 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2030  response regulator receiver protein  28.09 
 
 
597 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351446  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2125  response regulator receiver protein  31.11 
 
 
332 aa  63.5  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.551228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5619  hypothetical protein  26.86 
 
 
370 aa  63.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.162729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3642  hypothetical protein  27.11 
 
 
424 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.582589  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3783  hypothetical protein  27.71 
 
 
438 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0191  response regulator receiver protein  28.09 
 
 
570 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.67 
 
 
570 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3700  hypothetical protein  27.11 
 
 
438 aa  60.1  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.187809  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  45.59 
 
 
575 aa  58.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0683  hypothetical protein  24.82 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000715999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0173  response regulator receiver protein  26.4 
 
 
570 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000162346 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.38 
 
 
564 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0479  hypothetical protein  28.57 
 
 
373 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.582539  normal  0.378681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  38.89 
 
 
570 aa  54.7  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1863  response regulator receiver protein  28.93 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3814  response regulator receiver protein  23.89 
 
 
735 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.706947  hitchhiker  0.0056347 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  48 
 
 
637 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3829  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
713 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0106552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.46 
 
 
566 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3688  response regulator receiver domain-containing protein  39.71 
 
 
718 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3746  response regulator receiver protein  39.71 
 
 
714 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374039  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
553 aa  49.3  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1986  response regulator receiver domain-containing protein  30.89 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0853  type II secretion system protein E  45.1 
 
 
561 aa  49.7  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000472298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
574 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2577  hypothetical protein  28.1 
 
 
359 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.378417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0125  response regulator receiver protein  23.78 
 
 
1131 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915528  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  35.09 
 
 
574 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  36.84 
 
 
574 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1892  response regulator receiver protein  30.08 
 
 
442 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1977  response regulator receiver protein  30.08 
 
 
431 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0882  response regulator receiver protein  25 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.280434  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  36.84 
 
 
570 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.07 
 
 
554 aa  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  43.48 
 
 
563 aa  47.4  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  35.05 
 
 
568 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4695  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.35 
 
 
703 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0225348  normal  0.13115 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3618  bacteriophage N4 adsorption protein B  40.35 
 
 
703 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  28.92 
 
 
1141 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  42.11 
 
 
582 aa  47  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  46.3 
 
 
571 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4273  general secretion pathway protein E  40 
 
 
552 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.18 
 
 
787 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  44.64 
 
 
564 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4417  response regulator receiver protein  38.57 
 
 
442 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.628973  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
589 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  36.84 
 
 
577 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0372  response regulator receiver protein  44.9 
 
 
340 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.463682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
555 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  37.29 
 
 
553 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  36.54 
 
 
585 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  37.25 
 
 
562 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.66 
 
 
571 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2678  hypothetical protein  26.88 
 
 
266 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000293714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5548  response regulator receiver protein  32.58 
 
 
849 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.646802 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
567 aa  44.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.33 
 
 
560 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00120985 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  43.4 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.25 
 
 
563 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.82 
 
 
568 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0930  hypothetical protein  25.18 
 
 
268 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.745999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  44 
 
 
561 aa  44.3  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2061  hypothetical protein  39.66 
 
 
356 aa  43.9  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264827  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4262  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 
451 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2943  bacteriophage N4 adsorption protein B  39.66 
 
 
573 aa  43.9  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493194  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
559 aa  43.9  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0435  MSHA biogenesis protein MshE, putative  40 
 
 
549 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  45.65 
 
 
594 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  24.42 
 
 
317 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  32.99 
 
 
568 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4396  response regulator receiver protein  35.71 
 
 
469 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>