More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2853 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2853  cysteine synthase A  100 
 
 
311 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000434249  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2759  cysteine synthase A  99.68 
 
 
311 aa  618  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2668  cysteine synthase  96.46 
 
 
311 aa  550  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.456987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2487  cysteine synthase A  83.12 
 
 
309 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.074698 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2677  cysteine synthase A  80.46 
 
 
309 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.601381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2581  cysteine synthase A  79.8 
 
 
309 aa  489  1e-137  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1280  cysteine synthase  79.15 
 
 
309 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0485567  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2647  cysteine synthase A  82.41 
 
 
310 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.100926  normal  0.593402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12358  cysteine synthase A cysK1  71.66 
 
 
310 aa  422  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2427  cysteine synthase  70.16 
 
 
309 aa  410  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00952791  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1022  cysteine synthase A  68.2 
 
 
310 aa  401  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0422971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1840  cysteine synthase  63.43 
 
 
311 aa  394  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000292185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2422  cysteine synthase  66.34 
 
 
308 aa  393  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0516344 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0420  cysteine synthase A  65.23 
 
 
311 aa  390  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.858609  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1983  cysteine synthase A  65.69 
 
 
309 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.722669  normal  0.957709 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2003  cysteine synthase A  65.57 
 
 
308 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.537357 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1336  cysteine synthase A  65.9 
 
 
311 aa  385  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  65.15 
 
 
314 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2233  cysteine synthase A  64.26 
 
 
308 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2853  cysteine synthase A  63.09 
 
 
320 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2021  cysteine synthase A  68.4 
 
 
309 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0166882  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0030  cysteine synthase A  61.69 
 
 
311 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4128  cysteine synthase  65.15 
 
 
310 aa  382  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1385  cysteine synthase  59.93 
 
 
311 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.9014  normal  0.484311 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1219  cysteine synthase A  65.03 
 
 
309 aa  384  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.913066  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1235  cysteine synthase  64.31 
 
 
320 aa  383  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.779914  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  65.25 
 
 
309 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2176  cysteine synthase A  62.78 
 
 
309 aa  378  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0452  cysteine synthase  64.52 
 
 
319 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118838 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1506  cysteine synthase A  69.28 
 
 
309 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000603625  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2000  cysteine synthase A  63.78 
 
 
317 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.982832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2364  cysteine synthase  62.87 
 
 
310 aa  379  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.174971  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3334  cysteine synthase A  67.32 
 
 
309 aa  376  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.229416  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2508  cysteine synthase  64.84 
 
 
320 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000293117  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1551  cysteine synthase K/M/A  62.21 
 
 
317 aa  375  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1558  cysteine synthase  66.34 
 
 
309 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4407  cysteine synthase A  63.73 
 
 
328 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.119856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  63.82 
 
 
311 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3400  cysteine synthase  62.26 
 
 
313 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2096  cysteine synthase  63.52 
 
 
323 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.553585  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2657  cysteine synthase A  69.28 
 
 
309 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.249918  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1390  cysteine synthase  65.79 
 
 
311 aa  376  1e-103  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  0.100727 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5019  cysteine synthase  62.58 
 
 
320 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0961303  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1466  cysteine synthase  66.45 
 
 
334 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00108529  normal  0.10478 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3782  cysteine synthase  61.94 
 
 
320 aa  372  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00462193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  62.18 
 
 
330 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5034  cysteine synthase A  63.55 
 
 
320 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2067  cysteine synthase A  61.69 
 
 
327 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.197318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0452  cysteine synthases  66.01 
 
 
308 aa  368  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2560  cysteine synthase A  65.57 
 
 
310 aa  369  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1149  cysteine synthase A  63.43 
 
 
311 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000025777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1971  cysteine synthase  63.07 
 
 
308 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000186941  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0413  cysteine synthase  61.44 
 
 
309 aa  368  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3416  cysteine synthase  60.53 
 
 
311 aa  368  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  57.52 
 
 
312 aa  366  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3549  cysteine synthase A  62.66 
 
 
322 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1502  cysteine synthase A  63.55 
 
 
321 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18267e-17 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  61.33 
 
 
320 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  62.42 
 
 
311 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0075  cysteine synthase A  64.82 
 
 
328 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1615  cysteine synthase A  60.2 
 
 
308 aa  364  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  57.52 
 
 
312 aa  363  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  61.44 
 
 
311 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2609  cysteine synthase A  64.47 
 
 
311 aa  363  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  61.97 
 
 
308 aa  362  3e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0213  cysteine synthase  63.96 
 
 
329 aa  360  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0914276  normal  0.144885 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0477  cysteine synthase  65.47 
 
 
332 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1638  cysteine synthase A  61.64 
 
 
309 aa  360  2e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444809  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0011  cysteine synthase A  59.87 
 
 
310 aa  360  2e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.857978  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0433  cysteine synthase A  64.19 
 
 
320 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0444  cysteine synthase A  64.19 
 
 
320 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00894315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0559  cysteine synthase A  63.52 
 
 
332 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.770107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1258  cysteine synthase K/M/A  63.19 
 
 
327 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198511  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3186  cysteine synthase A  60.39 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000213805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0343  cysteine synthase A  65.15 
 
 
332 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal  0.476462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0364  cysteine synthase  63.19 
 
 
322 aa  357  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  61.11 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  60.47 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2014  cysteine synthase A  61.17 
 
 
309 aa  356  1.9999999999999998e-97  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0113  normal  0.0387372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2237  cysteine synthase A  60.32 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.425208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3794  cysteine synthase  60.06 
 
 
339 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  60.33 
 
 
320 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2871  cysteine synthase A  61.24 
 
 
318 aa  355  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2681  cysteine synthase A  61.64 
 
 
308 aa  355  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0782138 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0921  cysteine synthase A  59.28 
 
 
317 aa  353  2e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4307  cysteine synthase  61.11 
 
 
309 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.782932  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1476  cysteine synthase A  58.6 
 
 
324 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  60.98 
 
 
308 aa  352  4e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2182  cysteine synthase A  60.97 
 
 
316 aa  351  8e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4605  cysteine synthase A  62.66 
 
 
320 aa  351  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0835238 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3653  cysteine synthase A  60.59 
 
 
319 aa  350  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528018  hitchhiker  1.6930700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4340  cysteine synthase A  62.99 
 
 
320 aa  350  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.238175  normal  0.899822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0178  cysteine synthase A  62.66 
 
 
331 aa  348  7e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4466  cysteine synthase A  60.91 
 
 
327 aa  348  8e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5186  cysteine synthase A  60.59 
 
 
327 aa  348  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129775  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  61.11 
 
 
309 aa  347  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0433  cysteine synthase K/M/A  55.37 
 
 
307 aa  346  2e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.818582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4360  cysteine synthase  60.91 
 
 
322 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0922  cysteine synthase A  54.25 
 
 
304 aa  345  4e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.107998  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04800  cysteine synthase A  59.87 
 
 
309 aa  345  4e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000597368  normal  0.814351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>