201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2779 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  98.52 
 
 
405 aa  755    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  90.42 
 
 
407 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  100 
 
 
405 aa  764    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  25.78 
 
 
405 aa  137  4e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
395 aa  124  3e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  25.26 
 
 
376 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 
397 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  25.13 
 
 
383 aa  107  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 
383 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  25.65 
 
 
383 aa  106  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 
383 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 
379 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 
381 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  23.53 
 
 
381 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  25.07 
 
 
378 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  23.8 
 
 
382 aa  102  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
397 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  24.87 
 
 
381 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  24.58 
 
 
392 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  24.7 
 
 
780 aa  99  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  24.44 
 
 
399 aa  97.4  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  27.79 
 
 
371 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
377 aa  95.5  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  23.7 
 
 
379 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  23.6 
 
 
383 aa  93.6  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  24.61 
 
 
384 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  24.22 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  23.66 
 
 
384 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  26.72 
 
 
386 aa  90.1  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25 
 
 
377 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  26.92 
 
 
374 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.68 
 
 
382 aa  87.8  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  25.86 
 
 
381 aa  86.3  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1340  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 
378 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.46 
 
 
383 aa  86.7  8e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  25.35 
 
 
293 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 
496 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  23.9 
 
 
377 aa  83.6  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  22.06 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  26.77 
 
 
387 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0404  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2927  ABC-2 type transporter  24.81 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  31.89 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  20.64 
 
 
378 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  26.83 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  25.26 
 
 
382 aa  80.9  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  21.95 
 
 
382 aa  79.7  0.00000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  24.79 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  21.3 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24.17 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  25.14 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  23.36 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.54 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  26.12 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.08 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 
388 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.21 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  22.96 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.93 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  23.59 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  22.99 
 
 
369 aa  72  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  23.76 
 
 
371 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  23.82 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  24.89 
 
 
362 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  24.03 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4201  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  24.37 
 
 
387 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  24.92 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  24.18 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0458  ABC-2 type transporter  23.92 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  24.14 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.73 
 
 
372 aa  69.7  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  25.52 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  20.79 
 
 
371 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  22.92 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  25.91 
 
 
402 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.53 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 
373 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  24.12 
 
 
373 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4570  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
417 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.94 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  27.3 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  24.87 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.59 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  21.22 
 
 
367 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 
369 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  22.07 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  23.73 
 
 
378 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  26.27 
 
 
691 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.42 
 
 
368 aa  64.3  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>