More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2578 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  99.48 
 
 
194 aa  380  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  100 
 
 
194 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  94.85 
 
 
194 aa  344  6e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  52.9 
 
 
169 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  47.85 
 
 
185 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  45.81 
 
 
164 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  45.16 
 
 
178 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  50 
 
 
165 aa  137  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  46.81 
 
 
169 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  42.11 
 
 
185 aa  135  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  47.62 
 
 
157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  41.52 
 
 
185 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  46.15 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  43.23 
 
 
164 aa  130  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  44.76 
 
 
162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  41.94 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  41.52 
 
 
194 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  41.07 
 
 
181 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  42.5 
 
 
194 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  42.07 
 
 
192 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.76 
 
 
164 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  42.86 
 
 
179 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  40.65 
 
 
163 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  38.12 
 
 
171 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.95 
 
 
164 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  42.14 
 
 
166 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.76 
 
 
164 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  42.07 
 
 
173 aa  121  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  38.61 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  41.5 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  47.37 
 
 
167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  42.66 
 
 
164 aa  118  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  45.96 
 
 
157 aa  117  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  39.75 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  41.26 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  40.25 
 
 
164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1400  CheW protein  42.11 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.527066  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  44.08 
 
 
163 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  41.21 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  41.83 
 
 
163 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  41.83 
 
 
163 aa  115  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  43.75 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  40.88 
 
 
187 aa  115  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  40.52 
 
 
163 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  42.11 
 
 
179 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  42.95 
 
 
163 aa  114  8.999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  38.51 
 
 
158 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  41.26 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  41.26 
 
 
165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  38.29 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  45.14 
 
 
165 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  38.32 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  36.6 
 
 
167 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  40.26 
 
 
162 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  38.65 
 
 
174 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  40.51 
 
 
179 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  42.07 
 
 
165 aa  112  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  42.07 
 
 
165 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  37.24 
 
 
164 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  45.07 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  36.75 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  38.51 
 
 
171 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  39.33 
 
 
171 aa  110  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  36.14 
 
 
175 aa  110  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  38.04 
 
 
166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  38.89 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  42.67 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  36.02 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  38.07 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  42.07 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0656  CheW protein  38.75 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.211882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0612  CheW protein  46.46 
 
 
166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.398331 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  37.5 
 
 
171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  39.86 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  37.5 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  37.5 
 
 
177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  38.06 
 
 
178 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  37.43 
 
 
168 aa  109  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  38.12 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  38.22 
 
 
171 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  41.88 
 
 
185 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  39.01 
 
 
178 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
158 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  44.14 
 
 
205 aa  108  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  43.92 
 
 
158 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  43.71 
 
 
170 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  39.58 
 
 
183 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3029  CheW protein  42.25 
 
 
163 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.29 
 
 
218 aa  108  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>