More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2480 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  39.55 
 
 		 1496 aa  688    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  48.82 
 
 		 1055 aa  876    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1032 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  39.07 
 
 		 1038 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1028 aa  2006    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  40.08 
 
 		 1071 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  38.95 
 
 		 1041 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  38.89 
 
 		 1050 aa  686    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1476  acriflavin resistance protein  92.9 
 
 		 1028 aa  1789    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1047 aa  735    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  38.78 
 
 		 1036 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  38.21 
 
 		 1095 aa  665    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  40.73 
 
 		 1470 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  96.98 
 
 		 1028 aa  1902    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  38.29 
 
 		 1009 aa  640    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0559  acriflavin resistance protein  40 
 
 		 1062 aa  697    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  41.38 
 
 		 1039 aa  704    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  40.62 
 
 		 1033 aa  653    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  37.75 
 
 		 1065 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  37.02 
 
 		 1070 aa  641    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  38.81 
 
 		 1069 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  63.83 
 
 		 1028 aa  1198    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  37.91 
 
 		 1075 aa  634  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  41.67 
 
 		 1045 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1183  acriflavin resistance protein  42 
 
 		 1038 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317348  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.76 
 
 		 1024 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2601  acriflavin resistance protein  38.22 
 
 		 1066 aa  624  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0237  acriflavin resistance protein  39.75 
 
 		 1054 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0248  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1054 aa  619  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  39.65 
 
 		 1054 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2688  acriflavin resistance protein  41.88 
 
 		 1044 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.405984  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0238  acriflavin resistance protein  39.05 
 
 		 1067 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  34.91 
 
 		 1053 aa  609  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1014 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1022 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1022 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  36.52 
 
 		 1024 aa  603  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0211  acriflavin resistance protein  36.65 
 
 		 1026 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.824478 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  35.95 
 
 		 1040 aa  597  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0122  acriflavin resistance protein  34.1 
 
 		 1073 aa  596  1e-169  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00495446  hitchhiker  0.00000000019698 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1440  resistance-nodulation-cell division family transporter  35.56 
 
 		 1013 aa  598  1e-169  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.150547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  34.96 
 
 		 1039 aa  597  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  36.16 
 
 		 1042 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  34.37 
 
 		 1048 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0806  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1042 aa  585  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.326964 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1048 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  35.75 
 
 		 1043 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1059 aa  582  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  32.81 
 
 		 1050 aa  582  1e-164  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 		 1044 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  36.97 
 
 		 1023 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1989  acriflavin resistance protein  36.81 
 
 		 1031 aa  581  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1040 aa  577  1.0000000000000001e-163  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  35.39 
 
 		 1050 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  32.49 
 
 		 1040 aa  577  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  33.66 
 
 		 1034 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1044 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  33.43 
 
 		 1011 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  33.46 
 
 		 1068 aa  574  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  33.2 
 
 		 1034 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1041 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2024  acriflavin resistance protein  33.75 
 
 		 1058 aa  570  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000109059  normal  0.508224 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  32.76 
 
 		 1058 aa  571  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  33.79 
 
 		 1036 aa  570  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  32.89 
 
 		 1063 aa  571  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  35.6 
 
 		 1040 aa  572  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  37.35 
 
 		 1041 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  35.53 
 
 		 1029 aa  566  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.34 
 
 		 1024 aa  568  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  35.09 
 
 		 1060 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1787  acriflavin resistance protein  36.42 
 
 		 1044 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.342493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  35.74 
 
 		 1036 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1148  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1048 aa  563  1.0000000000000001e-159  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.356784  normal  0.75467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  36.3 
 
 		 1046 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2498  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 		 1041 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  32.82 
 
 		 1041 aa  561  1e-158  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  36.53 
 
 		 1037 aa  561  1e-158  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  35.69 
 
 		 1088 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  32.55 
 
 		 1058 aa  560  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  33.98 
 
 		 1034 aa  559  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2022  acriflavin resistance protein  37.06 
 
 		 1041 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.625222  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0885  acriflavin resistance protein  35.33 
 
 		 1053 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  34.9 
 
 		 1058 aa  559  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  36.4 
 
 		 1035 aa  557  1e-157  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  35.71 
 
 		 1025 aa  556  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  32.56 
 
 		 1030 aa  558  1e-157  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  32.81 
 
 		 1035 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  32.75 
 
 		 1032 aa  554  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  33.69 
 
 		 1035 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  32.14 
 
 		 1037 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  35.41 
 
 		 1044 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  36.2 
 
 		 1035 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2855  cation efflux transporter  35.25 
 
 		 1088 aa  551  1e-155  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.478721  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0907  acriflavin resistance protein  35.68 
 
 		 1043 aa  549  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.582716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1438  acriflavin resistance protein  35.31 
 
 		 1088 aa  552  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.539754  normal  0.0180094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1667  acriflavin resistance protein  36.19 
 
 		 1037 aa  552  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.29656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  32.38 
 
 		 1033 aa  549  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  34.02 
 
 		 1038 aa  547  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  32.57 
 
 		 1026 aa  545  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2137  putative transporter lipoprotein transmembrane  36.83 
 
 		 1028 aa  546  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.379778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>