280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2349 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2349  3'-5' exonuclease  100 
 
 		 288 aa  568  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2261  3'-5' exonuclease  99.65 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1602  3'-5' exonuclease  96.88 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2211  3'-5' exonuclease  70.7 
 
 		 296 aa  391  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.493178  normal  0.0213505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0414  3'-5' exonuclease  43.68 
 
 		 295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3617  3'-5' exonuclease  41.84 
 
 		 382 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4287  3'-5' exonuclease  38.99 
 
 		 409 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.276505  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0443  ribonuclease D, putative  40.71 
 
 		 381 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3389  3'-5' exonuclease  38.93 
 
 		 382 aa  191  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3636  3'-5' exonuclease  40.65 
 
 		 381 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0237  3'-5' exonuclease  36.56 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000118749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0221  3'-5' exonuclease  36.56 
 
 		 377 aa  185  9e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3191  3'-5' exonuclease  37.72 
 
 		 382 aa  179  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0323  RNase D  36.52 
 
 		 375 aa  161  9e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.85777e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0859  3'-5' exonuclease  38.38 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2266  3'-5' exonuclease  40 
 
 		 403 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0322428 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0573  3'-5' exonuclease  36.73 
 
 		 352 aa  135  9e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1615  3'-5' exonuclease  34.86 
 
 		 396 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.47386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24120  ribonuclease D  39.11 
 
 		 413 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0108272  decreased coverage  0.00823573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0326  ribonuclease D  33.45 
 
 		 392 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0491656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1582  3'-5' exonuclease  39.25 
 
 		 427 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101577  normal  0.169535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6723  Ribonuclease D-like protein  37.36 
 
 		 408 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449964  normal  0.591917 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3676  3'-5' exonuclease  37.41 
 
 		 442 aa  129  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0342205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0509  ribonuclease D  32.86 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1901  HRDC:3'-5' exonuclease  38.11 
 
 		 420 aa  127  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1391  3'-5' exonuclease  38.49 
 
 		 416 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1761  3'-5' exonuclease  35.96 
 
 		 437 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0159451  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1548  3'-5' exonuclease  38.64 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.582452  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2832  3'-5' exonuclease  38.7 
 
 		 421 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15690  ribonuclease D  35.96 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.442056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2381  3'-5' exonuclease  36.59 
 
 		 407 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135711  hitchhiker  0.000308945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5178  3'-5' exonuclease  35.34 
 
 		 499 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1773  ribonuclease D  35.11 
 
 		 377 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.31629 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2378  ribonuclease D  31.03 
 
 		 388 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0306951  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12960  ribonuclease D  37.45 
 
 		 416 aa  116  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00837058  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1891  3'-5' exonuclease  36.4 
 
 		 420 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0605392  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68661  ribosomal RNA processing 3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 792 aa  112  7.000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5400  Ribonuclease D  33.22 
 
 		 396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1887  3'-5' exonuclease  36.26 
 
 		 418 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1470  3'-5' exonuclease  35.56 
 
 		 451 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1331  3'-5' exonuclease  33.85 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0588384  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16390  ribonuclease D  35.98 
 
 		 437 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1528  3'-5' exonuclease  35.21 
 
 		 451 aa  109  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.104904  normal  0.219047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6780  3'-5' exonuclease  35.61 
 
 		 443 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.780317 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39090  predicted protein  40.36 
 
 		 176 aa  108  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.967738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2199  3'-5' exonuclease  33.06 
 
 		 428 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.10077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2210  3'-5' exonuclease  33.06 
 
 		 428 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2256  3'-5' exonuclease  33.06 
 
 		 428 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0553877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2479  3'-5' exonuclease  33.72 
 
 		 426 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1338  ribonuclease D  28.36 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0672  Ribonuclease D  32.18 
 
 		 423 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1890  3'-5' exonuclease  36.14 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.359397  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03940  PM-scl autoantigen, putative  36.9 
 
 		 1016 aa  106  4e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1310  ribonuclease D  33.33 
 
 		 393 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0761558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06230  ribonuclease D  31.82 
 
 		 399 aa  106  6e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000184069  hitchhiker  0.0058155 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0507  ribonuclease D  31.23 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12696  hypothetical protein  32.96 
 
 		 438 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000231151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3900  ribonuclease D  32.51 
 
 		 377 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1297  ribonuclease D  32.7 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4591  ribonuclease D  32.7 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05001  exosome complex exonuclease Rrp6, putative (Eurofung)  34.66 
 
 		 1297 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333756  normal  0.453331 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1734  ribonuclease D  28.47 
 
 		 381 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.312389  decreased coverage  0.00186691 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1962  3'-5' exonuclease  36.78 
 
 		 416 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.128564  hitchhiker  0.0000452801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01138  ribonuclease D  29.43 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000796428  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2073  ribonuclease D  30.74 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2546  ribonuclease D  32.41 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4121  ribonuclease D  32.7 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.636005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47460  ribonuclease D  31.25 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1610  3'-5' exonuclease  30.96 
 
 		 383 aa  99.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.533574  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3921  3'-5' exonuclease  32.82 
 
 		 424 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0599222  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2374  ribonuclease D  30.6 
 
 		 384 aa  99.8  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0639  ribonuclease D  29.66 
 
 		 379 aa  99.8  5e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.706315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13750  ribonuclease D  34.44 
 
 		 399 aa  99.4  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2365  ribonuclease D  30.91 
 
 		 392 aa  99.4  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004089  ribonuclease D  31.56 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000003136  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1752  ribonuclease D  29.12 
 
 		 395 aa  97.4  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00607213  normal  0.281233 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1839  ribonuclease D  31.32 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0204908  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0883  3'-5' exonuclease  30.68 
 
 		 476 aa  97.1  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4097  ribonuclease D  31.25 
 
 		 393 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1829  ribonuclease D  31.32 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.299724 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01380  ribonuclease D  31.3 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2530  ribonuclease D  31.32 
 
 		 375 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00950185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1384  ribonuclease D  31.32 
 
 		 375 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0737977  normal  0.865883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2030  ribonuclease D  31.32 
 
 		 375 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.793256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1388  ribonuclease D  30.5 
 
 		 377 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1569  ribonuclease D  30.88 
 
 		 381 aa  96.3  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000054851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1316  ribonuclease D  30.96 
 
 		 375 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000119147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1959  ribonuclease D  30.96 
 
 		 375 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000313579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1500  ribonuclease D  31.34 
 
 		 375 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000854063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0042  ribonuclease D  28.73 
 
 		 395 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00728921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1656  3'-5' exonuclease  33.21 
 
 		 449 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.290963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01774  ribonuclease D  30.96 
 
 		 375 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1726  3'-5' exonuclease  35.39 
 
 		 417 aa  95.5  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0339876 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1892  ribonuclease D  30.96 
 
 		 375 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2112  ribonuclease D  32.11 
 
 		 396 aa  95.5  9e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01762  hypothetical protein  30.96 
 
 		 375 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2447  ribonuclease D  29.28 
 
 		 369 aa  95.5  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000149434  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2494  ribonuclease D  30.38 
 
 		 382 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.121397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1956  ribonuclease D  30.6 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000740588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1252  ribonuclease D  30.19 
 
 		 386 aa  95.1  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000481962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>