50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2314 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2314  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 		 744 aa  1333    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00748637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1634  WD-40 repeat-containing protein  95.3 
 
 		 744 aa  982    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.127792  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2226  Pyrrolo-quinoline quinone  99.06 
 
 		 744 aa  1321    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2177  Pyrrolo-quinoline quinone  60.03 
 
 		 749 aa  581  1e-164  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2083  Pyrrolo-quinoline quinone  35.54 
 
 		 392 aa  60.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397286  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  29.23 
 
 		 475 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2103  Pyrrolo-quinoline quinone  32 
 
 		 383 aa  54.3  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0841326  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  31.56 
 
 		 1454 aa  54.3  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  23.43 
 
 		 797 aa  53.9  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  31.58 
 
 		 374 aa  52.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3730  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 383 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109503  normal  0.588424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  23.62 
 
 		 1812 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1062  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  35.64 
 
 		 392 aa  52.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 		 407 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 		 432 aa  51.2  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  22.59 
 
 		 687 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.01 
 
 		 2272 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  25.93 
 
 		 352 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0667  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.9 
 
 		 385 aa  49.3  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1154  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  34.65 
 
 		 392 aa  49.3  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.536052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  30.35 
 
 		 901 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  28.77 
 
 		 386 aa  48.5  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  23.53 
 
 		 652 aa  47.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2569  Pyrrolo-quinoline quinone  26.49 
 
 		 531 aa  47.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  30.14 
 
 		 423 aa  47.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  27.86 
 
 		 422 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  28.87 
 
 		 619 aa  46.6  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1682 aa  46.6  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  29.06 
 
 		 440 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1729  Pyrrolo-quinoline quinone  33.18 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 963 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 		 795 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  24.06 
 
 		 653 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  25.82 
 
 		 422 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3606  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.83 
 
 		 393 aa  45.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.612684 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 		 431 aa  45.4  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  32.71 
 
 		 611 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3316  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  26.76 
 
 		 545 aa  45.1  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01070  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  25.49 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1597  transcription accessory protein, TEX  27.78 
 
 		 386 aa  44.7  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207769  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  44.7  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  22.5 
 
 		 486 aa  44.7  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  21.61 
 
 		 774 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.96 
 
 		 393 aa  44.3  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  26.29 
 
 		 457 aa  44.3  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  25.26 
 
 		 616 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0291  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.1 
 
 		 386 aa  44.3  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1218  lipoprotein transmembrane  30.41 
 
 		 388 aa  44.3  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.032892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  29.94 
 
 		 402 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>