More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2247 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  39.38 
 
 		 890 aa  636    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  46.38 
 
 		 882 aa  653    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  44.08 
 
 		 872 aa  709    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.9 
 
 		 858 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  52.21 
 
 		 871 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 892 aa  641    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 		 896 aa  751    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  47.17 
 
 		 897 aa  695    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  47.83 
 
 		 823 aa  692    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 892 aa  642    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 890 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  41.25 
 
 		 858 aa  652    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  49.22 
 
 		 880 aa  738    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  50.06 
 
 		 869 aa  820    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 892 aa  641    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.93 
 
 		 890 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  39.76 
 
 		 894 aa  637    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 895 aa  649    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  43.45 
 
 		 870 aa  740    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 853 aa  669    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  40.63 
 
 		 867 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  41.11 
 
 		 858 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  46.82 
 
 		 932 aa  764    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 		 896 aa  657    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  43.28 
 
 		 900 aa  670    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  45.91 
 
 		 868 aa  744    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  41.89 
 
 		 828 aa  640    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.12 
 
 		 854 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 863 aa  677    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 903 aa  675    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  48.07 
 
 		 898 aa  696    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 		 868 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  50.34 
 
 		 870 aa  801    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 862 aa  635    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  45.24 
 
 		 862 aa  669    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 873 aa  664    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 881 aa  719    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  53.17 
 
 		 872 aa  841    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  43.03 
 
 		 904 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.96 
 
 		 892 aa  641    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 		 882 aa  637    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  41.55 
 
 		 860 aa  672    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  84.58 
 
 		 882 aa  1338    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  46.21 
 
 		 863 aa  689    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  40.91 
 
 		 855 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  97.17 
 
 		 882 aa  1535    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.2 
 
 		 865 aa  708    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  49.38 
 
 		 870 aa  797    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  45.36 
 
 		 873 aa  769    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  41.52 
 
 		 887 aa  635    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.56 
 
 		 871 aa  680    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.41 
 
 		 863 aa  699    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 		 855 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  46.95 
 
 		 872 aa  646    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2157  DNA mismatch repair protein MutS  98.19 
 
 		 882 aa  1690    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.404203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 		 862 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  41.75 
 
 		 887 aa  679    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  38.35 
 
 		 868 aa  654    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 882 aa  1721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  42.39 
 
 		 886 aa  688    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.09 
 
 		 878 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  46.77 
 
 		 882 aa  731    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  43.76 
 
 		 875 aa  697    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  44.8 
 
 		 872 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  40.3 
 
 		 869 aa  650    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.07 
 
 		 869 aa  756    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  43.38 
 
 		 910 aa  641    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  39.47 
 
 		 860 aa  642    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 856 aa  648    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.72 
 
 		 910 aa  698    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.73 
 
 		 910 aa  700    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  48.64 
 
 		 872 aa  769    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  42.35 
 
 		 901 aa  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 861 aa  638    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 861 aa  636    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  44.49 
 
 		 878 aa  635    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  44.34 
 
 		 859 aa  722    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 		 864 aa  673    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 		 910 aa  637    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  45.39 
 
 		 891 aa  707    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 850 aa  656    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.63 
 
 		 892 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  47.23 
 
 		 837 aa  754    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  49.32 
 
 		 872 aa  799    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.39 
 
 		 857 aa  684    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  50.74 
 
 		 889 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  45.77 
 
 		 868 aa  683    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 861 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  44.01 
 
 		 910 aa  635  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 856 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 898 aa  634  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 892 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1519  DNA mismatch repair protein MutS  42.72 
 
 		 854 aa  630  1e-179  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00861946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  44.91 
 
 		 854 aa  632  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.71 
 
 		 871 aa  630  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 856 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  42.36 
 
 		 859 aa  630  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 856 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  42.02 
 
 		 874 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 856 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>