More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1976 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  56.91 
 
 		 614 aa  715    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 		 613 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  52.22 
 
 		 609 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 		 598 aa  686    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  54.26 
 
 		 627 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.76 
 
 		 600 aa  674    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  57.07 
 
 		 594 aa  697    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 606 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  51.71 
 
 		 614 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  51.47 
 
 		 605 aa  636    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 602 aa  643    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  99.84 
 
 		 615 aa  1241    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  52.96 
 
 		 599 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  93.01 
 
 		 616 aa  1171    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.04 
 
 		 614 aa  655    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.39 
 
 		 614 aa  655    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  51.55 
 
 		 614 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 597 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  55.95 
 
 		 596 aa  651    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.32 
 
 		 608 aa  686    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  52.95 
 
 		 613 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  54.96 
 
 		 650 aa  655    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 605 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.93 
 
 		 616 aa  674    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  51.65 
 
 		 622 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 		 610 aa  639    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  51.83 
 
 		 613 aa  644    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.29 
 
 		 596 aa  648    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 609 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54.82 
 
 		 601 aa  676    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  54.47 
 
 		 602 aa  688    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 608 aa  642    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 630 aa  650    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.26 
 
 		 599 aa  670    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  52.9 
 
 		 602 aa  642    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  54.76 
 
 		 598 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  54.42 
 
 		 614 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 608 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  655    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 615 aa  1241    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  53.2 
 
 		 619 aa  637    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  54.78 
 
 		 597 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  52.57 
 
 		 603 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  53.56 
 
 		 592 aa  643    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 		 608 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  98.54 
 
 		 615 aa  1229    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 		 620 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  53.54 
 
 		 596 aa  637    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  55.52 
 
 		 612 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 602 aa  645    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  50.82 
 
 		 612 aa  642    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  51.55 
 
 		 614 aa  654    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 608 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  55.57 
 
 		 632 aa  657    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  53.39 
 
 		 607 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.65 
 
 		 601 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  52.9 
 
 		 600 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.87 
 
 		 607 aa  648    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  56.4 
 
 		 605 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 593 aa  692    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  56.49 
 
 		 608 aa  682    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  53.52 
 
 		 610 aa  654    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 602 aa  639    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.88 
 
 		 605 aa  707    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 		 610 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.21 
 
 		 610 aa  667    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  54.95 
 
 		 596 aa  659    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  50.58 
 
 		 600 aa  635    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  51.49 
 
 		 602 aa  643    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 610 aa  695    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 		 608 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  54.61 
 
 		 597 aa  646    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.99 
 
 		 608 aa  650    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  57.79 
 
 		 608 aa  730    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  54.9 
 
 		 608 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.86 
 
 		 608 aa  656    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  55.02 
 
 		 613 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 		 606 aa  698    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  54.1 
 
 		 597 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  57.09 
 
 		 594 aa  671    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 		 608 aa  651    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 		 610 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  53.59 
 
 		 629 aa  643    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  54.59 
 
 		 601 aa  677    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  51.34 
 
 		 600 aa  639    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 602 aa  641    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>