99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1731 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2216  hypothetical protein  97.1 
 
 		 898 aa  1717    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.352223  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1658  hypothetical protein  99.11 
 
 		 898 aa  1811    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.131846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1731  multiheme cytochrome  100 
 
 		 898 aa  1825    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4083  hypothetical protein  36.71 
 
 		 826 aa  164  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0344261  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6275  decaheme c-type cytochrome, OmcA/MtrC family  34.08 
 
 		 741 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.772817 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2292  hypothetical protein  30.84 
 
 		 782 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4079  hypothetical protein  29.97 
 
 		 885 aa  135  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.299167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2299  hypothetical protein  30.4 
 
 		 809 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2524  decaheme cytochrome c  28.74 
 
 		 725 aa  120  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000418395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2695  decaheme cytochrome c  30.29 
 
 		 719 aa  119  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2522  decaheme cytochrome c  28.78 
 
 		 720 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1210  decaheme cytochrome c  29.24 
 
 		 727 aa  118  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.260087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1209  decaheme cytochrome c  28.05 
 
 		 729 aa  118  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00658895  normal  0.327868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2675  decaheme cytochrome c  30.97 
 
 		 724 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000733685  normal  0.0455406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1713  hypothetical protein  28.44 
 
 		 945 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.436521  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2509  decaheme cytochrome c  29.02 
 
 		 731 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000184393  hitchhiker  0.000632353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0875  hypothetical protein  28.72 
 
 		 893 aa  112  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0421546 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2577  decaheme cytochrome c  28.26 
 
 		 731 aa  111  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00883016  decreased coverage  0.00925289 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1779  decaheme cytochrome c  28.4 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4080  hypothetical protein  27 
 
 		 936 aa  108  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000183317  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3371  hypothetical protein  27.82 
 
 		 895 aa  107  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.94917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2636  decaheme cytochrome c  27.6 
 
 		 724 aa  107  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0910  hypothetical protein  29.94 
 
 		 731 aa  107  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.688824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1527  decaheme cytochrome c  28.37 
 
 		 722 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2697  decaheme cytochrome c  26.88 
 
 		 745 aa  105  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0633196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3588  decaheme cytochrome c  27.9 
 
 		 745 aa  104  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1208  decaheme cytochrome c  32.03 
 
 		 656 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.474569  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1579  decaheme cytochrome c  27.27 
 
 		 730 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874065  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1590  decaheme cytochrome c  28.01 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000452412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1526  decaheme cytochrome c  26.75 
 
 		 738 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.324001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1613  decaheme cytochrome c  27.03 
 
 		 730 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.166254 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2764  hypothetical protein  28.41 
 
 		 843 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.185672  hitchhiker  0.000000808171 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1478  decaheme cytochrome c  36.27 
 
 		 761 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.174618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1473  decaheme cytochrome c  36.27 
 
 		 761 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000262006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2874  decaheme cytochrome c  36.27 
 
 		 764 aa  98.2  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0594793  hitchhiker  0.00000891097 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1509  decaheme cytochrome c  36.27 
 
 		 764 aa  97.8  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3124  decaheme cytochrome c  27.58 
 
 		 741 aa  97.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00184772  hitchhiker  0.000042193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1528  decaheme cytochrome c MtrF  28.02 
 
 		 646 aa  97.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4048  hypothetical protein  24.56 
 
 		 764 aa  97.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1479  hypothetical protein  27.54 
 
 		 833 aa  96.7  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0424195  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2694  decaheme cytochrome c MtrF  27.2 
 
 		 640 aa  96.7  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1345  multiheme cytochrome  29.24 
 
 		 742 aa  96.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2521  decaheme cytochrome c MtrF  26.77 
 
 		 639 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1659  decaheme cytochrome c  35.23 
 
 		 758 aa  95.5  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1257  hypothetical protein  32 
 
 		 762 aa  95.5  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2613  decaheme cytochrome c  34.72 
 
 		 762 aa  94.4  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000355284  hitchhiker  0.00000740819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2787  decaheme cytochrome c  35.23 
 
 		 762 aa  94.4  8e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2680  decaheme cytochrome c  35.23 
 
 		 762 aa  94  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.463028  unclonable  0.0000643351 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1612  decaheme cytochrome c  29.74 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0130523  normal  0.2896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1614  decaheme cytochrome c MtrF  26.49 
 
 		 639 aa  93.6  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0474266  normal  0.168927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1589  decaheme cytochrome c  29.74 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000235795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4254  decaheme cytochrome c  29.97 
 
 		 729 aa  93.2  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.353597  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2696  hypothetical protein  24.25 
 
 		 822 aa  92.8  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2674  decaheme cytochrome c MtrF  27.48 
 
 		 639 aa  93.2  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0899912  normal  0.105553 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1578  decaheme cytochrome c  29.74 
 
 		 650 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000205402  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2637  decaheme cytochrome c  25.66 
 
 		 653 aa  92.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2763  decaheme cytochrome c MtrF  26.49 
 
 		 639 aa  91.7  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0120659  hitchhiker  0.0000444921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2765  decaheme cytochrome c  29.41 
 
 		 650 aa  91.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00105295  hitchhiker  0.000000731399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2525  decaheme cytochrome c  28.81 
 
 		 656 aa  91.3  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000837992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1591  decaheme cytochrome c MtrF  28.3 
 
 		 639 aa  91.3  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000158979  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  25.46 
 
 		 639 aa  90.9  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2698  decaheme cytochrome c  31.39 
 
 		 671 aa  90.5  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0681671  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2576  decaheme cytochrome c MtrF  26.8 
 
 		 639 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134423  decreased coverage  0.00876105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1244  hypothetical protein  30.45 
 
 		 742 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0505071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1380  decaheme cytochrome c  32.29 
 
 		 765 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2508  decaheme cytochrome c MtrF  26.16 
 
 		 639 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00292179  decreased coverage  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2676  decaheme cytochrome c  29.08 
 
 		 650 aa  89  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000503474  normal  0.0214929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1580  decaheme cytochrome c MtrF  25 
 
 		 639 aa  88.6  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0766819  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3573  decaheme cytochrome c  28.48 
 
 		 716 aa  88.2  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0963  hypothetical protein  26.23 
 
 		 816 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.830117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0918  decaheme cytochrome c  33.33 
 
 		 764 aa  87.8  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.613412  normal  0.552776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1778  decaheme cytochrome c  26.84 
 
 		 671 aa  87.4  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2603  hypothetical protein  28.31 
 
 		 742 aa  86.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0998  decaheme cytochrome c  30.24 
 
 		 766 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2510  decaheme cytochrome c  26.43 
 
 		 655 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0178218  hitchhiker  0.000666167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2578  decaheme cytochrome c  28.76 
 
 		 650 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00427395  decreased coverage  0.00803379 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1478  decaheme cytochrome c  28.8 
 
 		 663 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000254716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1525  decaheme cytochrome c  27.31 
 
 		 660 aa  84.3  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.100516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  26.45 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2379  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1111 aa  81.6  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.49944  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3466  hypothetical protein  25.48 
 
 		 785 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.724503 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2228  decaheme cytochrome c  31.96 
 
 		 755 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.236086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3108  hypothetical protein  26.02 
 
 		 788 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1268  hypothetical protein  25.93 
 
 		 789 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.487663  hitchhiker  0.00130496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0913  decaheme cytochrome c  31.82 
 
 		 770 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3251  hypothetical protein  26.01 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1187  hypothetical protein  26.01 
 
 		 778 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3286  hypothetical protein  26.78 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.909593  hitchhiker  0.000000468411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3098  hypothetical protein  25.19 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1211  decaheme cytochrome c MtrF  27.46 
 
 		 639 aa  72  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003776  decaheme cytochrome c MtrF  27.61 
 
 		 754 aa  60.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3353  hypothetical protein  28.97 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3163  hypothetical protein  37.04 
 
 		 857 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3200  hypothetical protein  29.03 
 
 		 820 aa  55.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3279  hypothetical protein  35.9 
 
 		 854 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0409  hypothetical protein  23.59 
 
 		 782 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2523  hypothetical protein  22.74 
 
 		 757 aa  48.5  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4161  hypothetical protein  25.38 
 
 		 785 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0782432 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2907  hypothetical protein  29.2 
 
 		 793 aa  44.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>