More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1714 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1641  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  97.67 
 
 
488 aa  847  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.119637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2233  GntR family transcriptional regulator  91.02 
 
 
488 aa  771  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.420665  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1714  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  100 
 
 
488 aa  913  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0550689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3289  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  49.9 
 
 
485 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  49.27 
 
 
485 aa  408  1e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444902  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1740  GntR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
494 aa  399  1e-110  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.844969  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4167  transcriptional regulator  47.85 
 
 
509 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117681  normal  0.924645 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4100  GntR family transcriptional regulator  48.14 
 
 
494 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3251  transcriptional regulator  48.14 
 
 
494 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4266  GntR family transcriptional regulator  48.14 
 
 
494 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.501313  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1688  GntR family transcriptional regulator  55.65 
 
 
491 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.82306  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3694  GntR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
494 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.385244  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4324  transcriptional regulator  48.95 
 
 
495 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.203783 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1208  GntR family transcriptional regulator  50.71 
 
 
574 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4318  GntR family transcriptional regulator  44.75 
 
 
504 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1682  transcriptional regulator  49.08 
 
 
493 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0192  GntR family regulatory protein  48.99 
 
 
570 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1805  GntR family transcriptional regulator  47.91 
 
 
504 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1600  GntR family regulatory protein  48.88 
 
 
493 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4510  transcriptional regulator  44.72 
 
 
489 aa  372  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111052  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0346  GntR family transcriptional regulator  48.85 
 
 
476 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03480  GntR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
473 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.29974e-15 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1085  GntR family transcriptional regulator  46.09 
 
 
475 aa  369  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.350273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4441  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  44.31 
 
 
490 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.944559 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0760  GntR family transcriptional regulator  44.42 
 
 
490 aa  368  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.996679  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3202  GntR family transcriptional regulator  42.98 
 
 
478 aa  352  9e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00416739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3750  GntR family transcriptional regulator  45.72 
 
 
477 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144993  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2013  GntR family transcriptional regulator  45.34 
 
 
498 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2153  transcriptional regulator  45.68 
 
 
502 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0387109 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0136  GntR family transcriptional regulator  48.1 
 
 
496 aa  336  6e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2172  GntR family transcriptional regulator  41.72 
 
 
477 aa  328  1e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5117  transcriptional regulator  40.64 
 
 
508 aa  312  8e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  2.08159e-08  normal  0.0731219 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1933  GntR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
490 aa  310  6e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.100433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5251  GntR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
509 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5342  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
509 aa  303  4e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  7.22465e-07 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0345  transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 
470 aa  303  5e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.469578  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5391  transcriptional regulator  39.55 
 
 
509 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253395  normal  0.0145041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5633  GntR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
517 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  6.15538e-06  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2297  GntR family transcriptional regulator  43.57 
 
 
501 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.35156  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2224  transcriptional regulator  42.47 
 
 
510 aa  299  8e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0182275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5056  regulatory protein, GntR  39.26 
 
 
520 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.52055e-05  normal  0.949132 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5076  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.91 
 
 
472 aa  296  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0130  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 
490 aa  296  7e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1108  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
492 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.851329 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1023  transcriptional regulator  37.42 
 
 
485 aa  289  9e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.582702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5145  transcriptional regulator  42.92 
 
 
516 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0989  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
485 aa  288  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5504  transcriptional regulator, GntR family  38.12 
 
 
520 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2546  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  38.16 
 
 
497 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4617  GntR family transcriptional regulator  42.77 
 
 
516 aa  287  3e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3267  transcriptional regulator  43.55 
 
 
492 aa  284  2e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5126  GntR family transcriptional regulator  43.01 
 
 
492 aa  285  2e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.835239  normal  0.332894 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2234  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.16 
 
 
497 aa  285  2e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0480  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
509 aa  284  3e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.320093  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1809  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
506 aa  284  3e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0430  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
506 aa  284  3e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1011  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  36.96 
 
 
485 aa  283  4e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1609  GntR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
569 aa  283  5e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0318445  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3352  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
485 aa  283  5e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3456  transcriptional regulator  44.72 
 
 
501 aa  282  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.987625  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2795  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  39.91 
 
 
500 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.77384  normal  0.599586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3003  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
487 aa  281  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.32  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1334  transcriptional regulator  38.44 
 
 
501 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71680  GntR family transcriptional regulator  46.04 
 
 
491 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1217  GntR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
501 aa  279  6e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000463  transcriptional regulator  31.51 
 
 
467 aa  279  7e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566945  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0515  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
498 aa  279  7e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3105  GntR family transcriptional regulator  38.22 
 
 
501 aa  279  7e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1480  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
502 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0133  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
502 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0988  transcriptional regulator  44.18 
 
 
502 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1398  GntR family transcriptional regulator  44.18 
 
 
502 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.309369  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1071  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
511 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.030835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4307  transcriptional regulator  39.37 
 
 
488 aa  278  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3403  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  40.21 
 
 
489 aa  277  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.335079 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0641  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
506 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371693  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6889  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  38.71 
 
 
515 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0343806  normal  0.248624 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5851  transcriptional regulator  41.13 
 
 
520 aa  276  4e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.475987  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3892  GntR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
492 aa  275  9e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.179019  normal  0.485504 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8097  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  43.57 
 
 
471 aa  276  9e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0395  GntR family transcriptional regulator  43.09 
 
 
497 aa  275  1e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2202  GntR family transcriptional regulator  40.43 
 
 
488 aa  274  2e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6316  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 
493 aa  275  2e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.910059  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0569  transcriptional regulator  38.84 
 
 
499 aa  274  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1925  GntR family transcriptional regulator  43.13 
 
 
488 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0817  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
506 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.389843  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2364  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
506 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0684851  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2503  GntR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
506 aa  273  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6219  putative transcriptional regulator  44.47 
 
 
491 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3711  transcriptional regulator  36.8 
 
 
504 aa  273  7e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0129081 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4833  GntR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
485 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3119  transcription regulator protein  42.83 
 
 
488 aa  271  1e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4320  transcriptional regulator  39.71 
 
 
521 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.268323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2934  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
513 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0025  transcriptional regulator  42.25 
 
 
481 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.17702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0891  transcriptional regulator  37.42 
 
 
504 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2302  GntR family regulatory protein  43.9 
 
 
502 aa  270  3e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5015  transcriptional regulator  43.15 
 
 
502 aa  270  3e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.301985  normal  0.695664 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3719  transcriptional regulator  39.24 
 
 
476 aa  270  3e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3109  GntR family transcriptional regulator  43.03 
 
 
502 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>