21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1713 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1713  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0219056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1640  hypothetical protein  98.43 
 
 
319 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2234  hypothetical protein  95.45 
 
 
316 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3394  hypothetical protein  54.34 
 
 
270 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.639222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  66.52 
 
 
316 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3444  hypothetical protein  47.1 
 
 
313 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000353163  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0293  hypothetical protein  60.85 
 
 
328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000169852  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  49.52 
 
 
283 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  46.23 
 
 
321 aa  220  3e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  43.45 
 
 
329 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  27.87 
 
 
288 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  36.7 
 
 
165 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  36.27 
 
 
165 aa  59.3  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000924261  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  26.8 
 
 
267 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  27.93 
 
 
213 aa  46.6  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000459083  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  22.58 
 
 
265 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  26.92 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  29 
 
 
145 aa  44.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000637648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  28.57 
 
 
182 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  26.11 
 
 
189 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4081  hypothetical protein  30.71 
 
 
273 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000218694  normal  0.0348171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>