83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1689 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1689  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.112167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2262  hypothetical protein  94.26 
 
 		 319 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.099345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1613  protein of unknown function DUF6 transmembrane  96.64 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.76207  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2087  LysR family transcriptional regulator  47.48 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  hitchhiker  0.0000000953173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3109  hypothetical protein  50.75 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0895719 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0746  DMT family permease  47.69 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1975  hypothetical protein  47.37 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0979714  hitchhiker  0.00214562 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2000  hypothetical protein  47.37 
 
 		 283 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389336  decreased coverage  0.00000000377823 
 
 
-
 
NC_003296  RS01739  hypothetical protein  49.28 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2935  hypothetical protein  51.44 
 
 		 286 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4790  membrane protein  44.57 
 
 		 285 aa  199  6e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.278325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0781  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.24 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1416  hypothetical protein  37.09 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.239593 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0856  hypothetical protein  59.3 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0559005  normal  0.228089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4266  hypothetical protein  40.99 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1656  hypothetical protein  49.82 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0479067  normal  0.122332 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4102  hypothetical protein  40.43 
 
 		 302 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.576037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3816  hypothetical protein  50.52 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1774  hypothetical protein  41.26 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0600  hypothetical protein  43.77 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.172684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1850  sensor protein GLPS  41.61 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.829384 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5364  hypothetical protein  48.41 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.929346 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3521  hypothetical protein  45.35 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.801415 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001148  permease  38.85 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270511  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1446  hypothetical protein  34.93 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06636  hypothetical protein  40.67 
 
 		 289 aa  162  8.000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1346  hypothetical protein  38.23 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0646  hypothetical protein  38.3 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00955347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2406  hypothetical protein  46.47 
 
 		 290 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1051  DMT superfamily efflux pump  38.02 
 
 		 254 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.226473  normal  0.464817 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2916  hypothetical protein  49.27 
 
 		 282 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.264108  normal  0.862431 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1433  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.21 
 
 		 296 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38950  hypothetical protein  50.35 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2254  hypothetical protein  45.72 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.290541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1891  hypothetical protein  41.38 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1068  hypothetical protein  36.14 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3356  hypothetical protein  41.67 
 
 		 287 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6146  hypothetical protein  41.33 
 
 		 302 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3318  hypothetical protein  47.7 
 
 		 286 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6439  hypothetical protein  41.54 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.719443 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1087  hypothetical protein  49.8 
 
 		 281 aa  135  9e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.647653 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02132  permease of the drug/metabolite transporter superfamily protein  40.1 
 
 		 194 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.259073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46360  hypothetical protein  50.2 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.206778  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  37.61 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  33.64 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8212  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.33 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.87 
 
 		 315 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00560  permease  27.34 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.44 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00112924  normal  0.142553 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0764  DMT family permease  40.85 
 
 		 119 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.18822 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  29.79 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2435  hypothetical protein  25.75 
 
 		 303 aa  47  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0579  integral membrane protein  31.56 
 
 		 426 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.431063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2345  hypothetical protein  32.8 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2733  multidrug ABC transporter permease  32.8 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001929  permease  25.18 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  23.84 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0696  hypothetical protein  32.8 
 
 		 376 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1802  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.54 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  30.86 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.66 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0875  integral membrane protein  32.8 
 
 		 312 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1039  hypothetical protein  29.53 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.371653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  30.52 
 
 		 335 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2183  hypothetical protein  35.56 
 
 		 314 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0710  hypothetical protein  32.8 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2401  hypothetical protein  24.11 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2545  hypothetical protein  24.11 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.73 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0384  hypothetical protein  23.43 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.128804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.88 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  40.58 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.17 
 
 		 312 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  32.84 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1695  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.173483  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0574  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1766  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35 
 
 		 314 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.548508  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  35.48 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>