More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1688 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1688  PEP phosphonomutase  100 
 
 
279 aa  537  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.251205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1612  PEP phosphonomutase  97.85 
 
 
279 aa  507  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2263  PEP phosphonomutase  89.53 
 
 
279 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.978238  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0568  hypothetical protein  58.36 
 
 
274 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6009  hypothetical protein  59.78 
 
 
280 aa  295  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00237397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4222  hypothetical protein  59.48 
 
 
275 aa  291  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.333624  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4153  hypothetical protein  55.51 
 
 
274 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.847864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4352  hypothetical protein  56.51 
 
 
272 aa  289  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.174132  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2180  hypothetical protein  55.35 
 
 
271 aa  285  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0150751  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5017  putative methylisocitrate lyase or carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  55.73 
 
 
271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467428 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3644  hypothetical protein  59.27 
 
 
276 aa  271  9e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.354902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0122  hypothetical protein  59.7 
 
 
276 aa  267  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1745  hypothetical protein  55.89 
 
 
276 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3722  hypothetical protein  55.6 
 
 
273 aa  262  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7278  hypothetical protein  58.7 
 
 
280 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00843163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1074  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  51.33 
 
 
278 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3650  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  55.09 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.822886  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5224  hypothetical protein  54.04 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0320197  normal  0.104885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4063  hypothetical protein  54.41 
 
 
267 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.196405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1510  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  53.16 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.685837  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1325  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4212  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  52.42 
 
 
276 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.558651 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1372  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  50.74 
 
 
278 aa  228  8e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.831005  normal  0.137367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1115  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  52.42 
 
 
276 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1448  hypothetical protein  53.65 
 
 
279 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3694  PEP phosphonomutase  55.87 
 
 
286 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329743  normal  0.378835 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1389  hypothetical protein  50 
 
 
275 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000372272  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4107  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  50.93 
 
 
276 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1456  hypothetical protein  51.64 
 
 
274 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16740  hypothetical protein  51.64 
 
 
274 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8089  PEP phosphonomutase  47.78 
 
 
274 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4869  PEP phosphonomutase  56.28 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21038  hitchhiker  0.00000793453 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2802  hypothetical protein  47.39 
 
 
278 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.317432  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2258  hypothetical protein  49.03 
 
 
276 aa  201  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3087  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  48.46 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0439719  normal  0.397563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2201  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase, putative  48.9 
 
 
281 aa  199  5e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00814551  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4919  PEP phosphonomutase  54.25 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0062527  normal  0.246577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3448  PEP phosphonomutase  54.25 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.36236  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5368  PEP phosphonomutase  54.25 
 
 
286 aa  198  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0658873  normal  0.17569 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4353  PEP phosphonomutase  55.87 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4820  PEP phosphonomutase  50.78 
 
 
275 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0773  PEP phosphonomutase  55.06 
 
 
286 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314114  normal  0.0162406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3098  PEP phosphonomutase  45.21 
 
 
288 aa  180  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3894  hypothetical protein  47.25 
 
 
274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.077508  normal  0.524503 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2774  hypothetical protein  47.35 
 
 
276 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1600  hypothetical protein  43.44 
 
 
276 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.768763  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2446  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  37.36 
 
 
284 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.111219  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1626  hypothetical protein  40.61 
 
 
287 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298645  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1920  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase-like protein  41.6 
 
 
271 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3620  hypothetical protein  41.76 
 
 
276 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5270  hypothetical protein  29.56 
 
 
274 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3525  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  29.09 
 
 
274 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0706  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  43.87 
 
 
278 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.642539  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2296  hypothetical protein  40 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00410  PEP phosphonomutase-like enzyme  40.94 
 
 
286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0254511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3070  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  30.91 
 
 
289 aa  125  9e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4372  hypothetical protein  31.91 
 
 
266 aa  122  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11441e-22 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0856  hypothetical protein  39.34 
 
 
264 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4524  hypothetical protein  32.36 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.725558  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0074  hypothetical protein  38.98 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0235  hypothetical protein  31.71 
 
 
258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4021  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  35.19 
 
 
294 aa  112  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5112  hypothetical protein  33.57 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3097  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  35.91 
 
 
274 aa  109  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000706406  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0879  hypothetical protein  34.02 
 
 
282 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3408  hypothetical protein  34.02 
 
 
277 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0163  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.44 
 
 
253 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.643607  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3483  hypothetical protein  34.02 
 
 
282 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0084  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  36.48 
 
 
256 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0220  hypothetical protein  37.8 
 
 
267 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0067  putative PEP phosphonomutase protein  36.05 
 
 
256 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103814  normal  0.0160234 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0044  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.669504  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2157  hypothetical protein  31.16 
 
 
265 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1604  hypothetical protein  38.32 
 
 
289 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5113  PEP phosphonomutase  40.83 
 
 
253 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0870889 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3606  hypothetical protein  33.2 
 
 
282 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.647928  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3519  hypothetical protein  39.84 
 
 
249 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.596575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2035  hypothetical protein  38.12 
 
 
255 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0247047  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1593  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  36.23 
 
 
260 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131647  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1053  hypothetical protein  33.2 
 
 
282 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6199  PEP phosphonomutase-like protein  38.43 
 
 
425 aa  99.8  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.3328  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0410  hypothetical protein  40.87 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5509  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  40.81 
 
 
273 aa  95.9  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  0.256202 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0391  hypothetical protein  34.66 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.935035  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3853  hypothetical protein  30.45 
 
 
266 aa  93.2  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12030  hypothetical protein  34.93 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  34.23 
 
 
282 aa  92.8  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4484  PEP phosphonomutase  40.42 
 
 
264 aa  93.2  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000284716  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2418  hypothetical protein  37.35 
 
 
242 aa  92.4  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206237  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2281  hypothetical protein  38.89 
 
 
253 aa  92  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0552  PEP phosphonomutase and related enzyme-like protein  37.34 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.668619  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3283  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  33.98 
 
 
255 aa  89.7  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  30.12 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0819  2-methylisocitrate lyase  31.54 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.445655  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1177  2-methylisocitrate lyase  31.54 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.984478  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  30.12 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1639  putative carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase protein  37.86 
 
 
260 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.401256  normal  0.866328 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  29.73 
 
 
284 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40267  predicted protein  33.46 
 
 
323 aa  86.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.158521  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0900  PEP phosphonomutase  33.88 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>