More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1677 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  58.09 
 
 
556 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  99.46 
 
 
555 aa  1098    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  98.19 
 
 
554 aa  1084    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  58.23 
 
 
548 aa  639    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 
555 aa  1102    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  62.06 
 
 
564 aa  666    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  57.52 
 
 
552 aa  622  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  56.84 
 
 
544 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  57.87 
 
 
565 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  54.6 
 
 
554 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  55.99 
 
 
540 aa  590  1e-167  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  54.58 
 
 
542 aa  589  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  53.56 
 
 
558 aa  588  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  55.03 
 
 
535 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  53.83 
 
 
545 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  53.53 
 
 
563 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 
563 aa  579  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  53.35 
 
 
563 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  53.11 
 
 
541 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  54.43 
 
 
554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  53.73 
 
 
557 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  53.87 
 
 
554 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  53.87 
 
 
554 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  52.52 
 
 
539 aa  554  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  51.62 
 
 
558 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  53.55 
 
 
565 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  52.97 
 
 
539 aa  550  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  53.11 
 
 
555 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  52.61 
 
 
541 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  53.8 
 
 
541 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 
543 aa  542  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  52.23 
 
 
558 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  52.39 
 
 
541 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  55.12 
 
 
528 aa  528  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  53.23 
 
 
543 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  53.04 
 
 
542 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  47.77 
 
 
587 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  45.5 
 
 
560 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  43.33 
 
 
548 aa  454  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  43.41 
 
 
541 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  45.28 
 
 
590 aa  455  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  44.79 
 
 
555 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  44.44 
 
 
555 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  44.79 
 
 
555 aa  449  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  44.49 
 
 
566 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  44.27 
 
 
555 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  43.88 
 
 
615 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  43.61 
 
 
559 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  44.89 
 
 
575 aa  442  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  42.49 
 
 
558 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  43.35 
 
 
562 aa  442  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  44.05 
 
 
565 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  43.18 
 
 
555 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  41.98 
 
 
541 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  43.17 
 
 
564 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0710  cytochrome c oxidase subunit I  47.91 
 
 
806 aa  438  1e-121  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153161  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  43.49 
 
 
559 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  42.49 
 
 
556 aa  437  1e-121  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  41.45 
 
 
541 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  41.26 
 
 
541 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  41.44 
 
 
546 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  43.66 
 
 
641 aa  435  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.22 
 
 
539 aa  435  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  41.44 
 
 
546 aa  434  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  43.87 
 
 
638 aa  434  1e-120  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  41.07 
 
 
552 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  42.93 
 
 
641 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  42.56 
 
 
554 aa  432  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0629  cytochrome c oxidase, subunit I  44.8 
 
 
796 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0326  cytochrome c oxidase subunit I  43.02 
 
 
526 aa  425  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.283481  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 
553 aa  424  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  42.59 
 
 
534 aa  425  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.19 
 
 
563 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0427  cytochrome c oxidase, subunit I  43.04 
 
 
535 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2405  cytochrome c oxidase, subunit I  42.3 
 
 
550 aa  419  1e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0406  cytochrome c oxidase, subunit I  43.64 
 
 
818 aa  421  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1423  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3196  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.94 
 
 
543 aa  415  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2850  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0508  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0490  cytochrome c oxidase, subunit I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.428765  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0673  cytochrome c oxidase polypeptide I  42.86 
 
 
535 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0425547  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  42.99 
 
 
537 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  43.61 
 
 
553 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0622  cytochrome c oxidase, subunit I  43.55 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000132617  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  42.12 
 
 
540 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0363  cytochrome C oxidase polypeptide I  43.1 
 
 
534 aa  415  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0980  cytochrome-c oxidase  43.31 
 
 
562 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0678468  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 
541 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  41.42 
 
 
669 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1003  cytochrome c oxidase, subunit I  42.52 
 
 
518 aa  413  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  43.4 
 
 
532 aa  415  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0169  cytochrome c oxidase, subunit I  42.67 
 
 
535 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.98257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  43.31 
 
 
542 aa  411  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056683  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  40.18 
 
 
555 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  43.49 
 
 
542 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1041  cytochrome c oxidase subunit I  42.08 
 
 
559 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.286412  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1644  cytochrome c oxidase, subunit I  42.94 
 
 
535 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336541  normal  0.908171 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1939  cytochrome-c oxidase  43.39 
 
 
543 aa  409  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0346979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>