More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1641 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1641  Ribonuclease Z  100 
 
 
322 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1563  Ribonuclease Z  91.02 
 
 
323 aa  579  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3238  beta-lactamase domain protein  53.16 
 
 
323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2705  putative hydrolase  47.19 
 
 
280 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3908  ribonuclease Z  40.74 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686381  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12435  ribonuclease Z  36.97 
 
 
280 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0772968  normal  0.994389 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3518  ribonuclease Z  40.27 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3506  ribonuclease Z  40.27 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3578  ribonuclease Z  40.27 
 
 
285 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0515692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2669  ribonuclease Z  39.51 
 
 
286 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0257959  normal  0.795732 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2670  ribonuclease Z  36 
 
 
364 aa  145  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.82455  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1204  hypothetical protein  31.89 
 
 
312 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.448383 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1068  putative periplasmic protein  31.89 
 
 
312 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1219  hypothetical protein  31.89 
 
 
312 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2355  beta-lactamase domain protein  34.54 
 
 
319 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.104048  normal  0.172704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1173  putative periplasmic protein  31.89 
 
 
312 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1184  hypothetical protein  31.89 
 
 
312 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454462  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3902  beta-lactamase-like  32.55 
 
 
312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2495  hydrolase protein  34.14 
 
 
320 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.618343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3906  beta-lactamase-like  32.4 
 
 
309 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2758  beta-lactamase domain protein  33.88 
 
 
321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1094  beta-lactamase domain protein  32.37 
 
 
395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0366496  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1451  ribonuclease Z  31.1 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2459  beta-lactamase domain-containing protein  27.76 
 
 
421 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02203  hydrolase  36.46 
 
 
334 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5998  metal-dependent hydrolase  30.39 
 
 
414 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403033  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2397  metallo-beta-lactamase  30.63 
 
 
283 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0681  beta-lactamase-like protein  31.34 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.142415  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17980  metal-dependent hydrolase, beta-lactamase superfamily III  31.15 
 
 
331 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182434  normal  0.52881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0210  putative hydrolase  29.12 
 
 
314 aa  106  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0205  hypothetical protein  31.89 
 
 
395 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0308  beta-lactamase domain-containing protein  30.8 
 
 
262 aa  106  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0855  beta-lactamase domain protein  28.79 
 
 
327 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.272669  normal  0.116171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0371  beta-lactamase domain-containing protein  31.18 
 
 
256 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.677057  normal  0.0150173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1722  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
324 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.261159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3235  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 
263 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00328629  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13830  hypothetical protein  29.58 
 
 
375 aa  96.7  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.491323  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2102  ribonuclease Z  22.49 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3785  putative tRNA 3' processing RNase Z-like protein  28.04 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0384  hypothetical protein  30.51 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0581145  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3513  beta-lactamase-like  28.62 
 
 
288 aa  91.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0371134  hitchhiker  0.000893101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1159  beta-lactamase domain-containing protein  31.2 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1365  hypothetical protein  26.71 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00000739768  hitchhiker  0.0000000312864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2366  hypothetical protein  28.62 
 
 
268 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3987  beta-lactamase domain-containing protein  29.67 
 
 
257 aa  89  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.706134  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1789  ribonuclease Z  23.38 
 
 
305 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1424  ribonuclease Z  23.41 
 
 
308 aa  85.9  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3142  metal dependent hydrolase  25.35 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.961345  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3866  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1066  AtsA/ElaC family protein  22.56 
 
 
306 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.583999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3197  ribonuclease Z  29.15 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0076  ribonuclease Z  29.75 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.887393  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2921  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0261886  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0588  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280528  normal  0.0107204 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0182  beta-lactamase-like protein  28.33 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.530565  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2866  beta-lactamase domain protein  31.16 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2271  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1970  beta-lactamase domain protein  29.08 
 
 
253 aa  77  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0859  beta-lactamase domain protein  27.3 
 
 
244 aa  77  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160927  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1067  ribonuclease Z  27.24 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.222642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2299  beta-lactamase domain-containing protein  31.55 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000114028  hitchhiker  0.00742291 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0415  beta-lactamase domain-containing protein  32.61 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0349  ribonuclease Z  25.5 
 
 
307 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6115  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1870  ribonuclease Z  25.22 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0876  beta-lactamase-like  26.23 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.440271  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0927  ribonuclease Z  26.97 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8808  beta-lactamase domain protein  30.24 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11850  predicted protein  28.24 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2187  ribonuclease Z  24.73 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0713  ribonuclease Z  23.49 
 
 
314 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0754  beta-lactamase-like  29.44 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0374984  normal  0.146735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2849  beta-lactamase-like  29.06 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1591  ribonuclease Z  23.89 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.125239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7555  beta-lactamase domain protein  29.7 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.731763  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1592  ribonuclease Z  26.8 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359546  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0339  beta-lactamase domain protein  29.76 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00080407  normal  0.0194254 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2276  ribonuclease Z  25 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000139422  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1561  ribonuclease Z  26.8 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1104  beta-lactamase domain-containing protein  31.87 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.342626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2119  beta-lactamase domain protein  29.85 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.329371  normal  0.846308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1733  Metal-dependent hydrolase of the beta-lactamase superfamily III-like protein  34.65 
 
 
250 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1162  beta-lactamase domain-containing protein  33.5 
 
 
257 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0992  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
248 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.122606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1016  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1179  ribonuclease Z  26.01 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0941  beta-lactamase domain-containing protein  32.34 
 
 
251 aa  71.2  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.504318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2014  ribonuclease Z  22.88 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.426384  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0153  ribonuclease Z  22.42 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.585164  normal  0.015686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5649  beta-lactamase domain-containing protein  28.4 
 
 
248 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1994  beta-lactamase domain-containing protein  30.3 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0401  ribonuclease Z  27.95 
 
 
305 aa  70.5  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0015  ribonuclease Z  21.88 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.134703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1860  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.150092 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1949  beta-lactamase domain protein  27.63 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.170959 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1716  ribonuclease Z  24.48 
 
 
316 aa  69.7  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0647  ribonuclease Z  26.69 
 
 
313 aa  69.7  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.834913  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0053  ribonuclease Z  33.77 
 
 
314 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1765  beta-lactamase domain-containing protein  30.06 
 
 
235 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000290014 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1788  ribonuclease Z  27.23 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>