129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1635 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1635  Rhomboid family protein  100 
 
 		 318 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1553  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  80.58 
 
 		 110 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  37.34 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  23.36 
 
 		 519 aa  66.2  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3791  intramembrane serine protease GlpG  29.13 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.666891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3832  intramembrane serine protease GlpG  29.13 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.555662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3716  intramembrane serine protease GlpG  29.13 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3725  intramembrane serine protease GlpG  29.13 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3894  intramembrane serine protease GlpG  29.13 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.478877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  31.9 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03275  predicted intramembrane serine protease  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.989873  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0290  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0312  intramembrane serine protease GlpG  35 
 
 		 274 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3621  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3900  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0290  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3704  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.144478 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03227  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4732  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3806  intramembrane serine protease GlpG  33.33 
 
 		 276 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3618  rhomboid-like protein  27.33 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000228786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3833  intramembrane serine protease GlpG  32.62 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.286062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  35 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  33.54 
 
 		 554 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  28.68 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4639  intramembrane serine protease GlpG  32.59 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1309  rhomboid-like protein  32.62 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3941  rhomboid family protein  24.34 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000502611  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3705  rhomboid family protein  34.88 
 
 		 364 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3996  intramembrane serine protease GlpG  28.25 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0158  intramembrane serine protease GlpG  28.25 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  28.97 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0064  rhomboid-like protein  34.59 
 
 		 292 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  28.68 
 
 		 342 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  32.09 
 
 		 523 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3756  intramembrane serine protease GlpG  28.25 
 
 		 259 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4123  intramembrane serine protease GlpG  28.25 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  28.31 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4483  rhomboid family protein  26.01 
 
 		 281 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141048  hitchhiker  0.00806857 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0055  rhomboid family protein  26.01 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000850289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4343  rhomboid family protein  26.01 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000172668  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4288  Rhomboid family protein  26.01 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0527453  hitchhiker  0.00000054615 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  24.51 
 
 		 365 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2070  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122974  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0095  glpG protein  25.91 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000920194  normal  0.0164253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3712  rhomboid family protein  28.91 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00085785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0104  rhomboid family protein  24.47 
 
 		 279 aa  53.1  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.465909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002143  protein GlpG  29.58 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00412305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3930  intramembrane serine protease GlpG  27.93 
 
 		 277 aa  52.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  29.17 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0123  putative glpG protein  32.39 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4671  glpG protein  29.77 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3903  rhomboid family protein  25.29 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000174103  normal  0.392188 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3995  rhomboid family protein  25.29 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00110696  normal  0.0215487 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  28.45 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  25.44 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  25.25 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4107  rhomboid family protein  25.29 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000304779  normal  0.532773 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3904  rhomboid family protein  25.73 
 
 		 281 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00422303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  31.49 
 
 		 489 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1155  rhomboid-like protein  36.59 
 
 		 155 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1735  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 340 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  30.91 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  32.16 
 
 		 360 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  35.25 
 
 		 369 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  33.57 
 
 		 541 aa  50.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.39 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  29.79 
 
 		 223 aa  49.7  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1574  rhomboid family protein  29.08 
 
 		 292 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.227659 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0276  Rhomboid family protein  31.08 
 
 		 220 aa  49.7  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.285023  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  32.75 
 
 		 360 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  27.23 
 
 		 284 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2078  rhomboid family protein  30.3 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.347543  normal  0.269308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  31.21 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  25.66 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  29.25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1220  Rhomboid family protein  31.29 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.231981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  28.57 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  31.58 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0098  rhomboid family protein  29.1 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.351068  hitchhiker  0.00489186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0062  rhomboid family protein  27.78 
 
 		 278 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.015636  hitchhiker  0.000000313005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2516  Rhomboid family protein  26.26 
 
 		 276 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.258607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00069  putative glpG protein  30.46 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  32.16 
 
 		 360 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  26.52 
 
 		 511 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  26.9 
 
 		 386 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0230  intramembrane serine protease GlpG  34.19 
 
 		 280 aa  47.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.838462  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2014  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2417  glpG protein  25.71 
 
 		 277 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  29.76 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5597  Rhomboid family protein  28.57 
 
 		 371 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3728  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42743  predicted protein  29.45 
 
 		 669 aa  46.6  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.599119  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  36.59 
 
 		 547 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  36.59 
 
 		 541 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1546  rhomboid family protein  30.88 
 
 		 295 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.546364 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  30 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  26.95 
 
 		 305 aa  46.2  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00275  peptidase  27.89 
 
 		 280 aa  46.2  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>