More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1562 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  99.38 
 
 
320 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  95.02 
 
 
333 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  78.24 
 
 
311 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  49.84 
 
 
320 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  44.41 
 
 
345 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  40.68 
 
 
311 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  44.32 
 
 
302 aa  206  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  41.72 
 
 
316 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  39.09 
 
 
318 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  39.09 
 
 
318 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  43.8 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  39.81 
 
 
319 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  39.61 
 
 
256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3706  patatin  41.25 
 
 
348 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0453278 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  43.63 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  42.36 
 
 
323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  44.02 
 
 
273 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  40.39 
 
 
260 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2086  patatin  43.13 
 
 
346 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.154282  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  37.74 
 
 
263 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  41.06 
 
 
272 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3839  phospholipase  38.87 
 
 
263 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.756458  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4137  phospholipase  38.87 
 
 
263 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.866358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3942  phospholipase, patatin family  38.87 
 
 
263 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3669  patatin-like phospholipase  38.49 
 
 
263 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0414578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3973  phospholipase, putative  38.49 
 
 
263 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.533695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  38.49 
 
 
263 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4039  phospholipase, patatin family  38.49 
 
 
263 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000244848  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3754  patatin  38.49 
 
 
263 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.517458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  38.87 
 
 
263 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4028  phospholipase, patatin family  38.87 
 
 
263 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0568187  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3827  Patatin  43.15 
 
 
253 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306968  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  37.54 
 
 
315 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  42.86 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  36.86 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  41.44 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  40.22 
 
 
358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  37.83 
 
 
346 aa  176  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  39.04 
 
 
346 aa  175  7e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  42.62 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  37.17 
 
 
335 aa  172  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  35.91 
 
 
790 aa  171  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  37.65 
 
 
748 aa  170  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  41.96 
 
 
308 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  36.51 
 
 
334 aa  169  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  36.63 
 
 
347 aa  168  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  36.26 
 
 
474 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  36.26 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0164  patatin  37.63 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  36.86 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  36.26 
 
 
347 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  35.25 
 
 
358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  30.9 
 
 
760 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  34.95 
 
 
751 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  36.23 
 
 
308 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  37.8 
 
 
301 aa  162  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  35.62 
 
 
728 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  36.12 
 
 
306 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  36.12 
 
 
305 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  36.12 
 
 
305 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  36.21 
 
 
728 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  36.29 
 
 
349 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  37.3 
 
 
302 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  33.74 
 
 
767 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  39.38 
 
 
803 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  37.7 
 
 
324 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  39.38 
 
 
803 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  39.38 
 
 
803 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  38.46 
 
 
707 aa  160  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  38.01 
 
 
796 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  35.4 
 
 
727 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  37.86 
 
 
920 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  34.38 
 
 
667 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  36.9 
 
 
302 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  37.86 
 
 
930 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  37.86 
 
 
933 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  37.86 
 
 
945 aa  159  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3593  patatin  46.88 
 
 
335 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0017391  normal  0.0781992 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  37.16 
 
 
275 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  38.36 
 
 
804 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5557  patatin  45.89 
 
 
323 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4178  patatin  45.41 
 
 
323 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.222124  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  37.86 
 
 
728 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  36.73 
 
 
259 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  38.25 
 
 
798 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  36.99 
 
 
813 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  37.05 
 
 
852 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  37.02 
 
 
275 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  35.44 
 
 
753 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1469  patatin  42.79 
 
 
323 aa  153  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.434308  normal  0.0917321 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1673  Patatin  46.24 
 
 
316 aa  152  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.797589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2082  patatin  46.24 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00726346  normal  0.98017 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  35.91 
 
 
275 aa  152  7e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  36.62 
 
 
777 aa  152  8e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  37.42 
 
 
714 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1851  Patatin  33.56 
 
 
320 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.202121  normal  0.0299677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  34.97 
 
 
733 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  32.18 
 
 
287 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  34.15 
 
 
750 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>