87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1502 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2453  hypothetical protein  97.55 
 
 
449 aa  890    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1502  hypothetical protein  100 
 
 
449 aa  909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00218363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1414  hypothetical protein  74.6 
 
 
447 aa  690    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.792447  normal  0.210387 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1406  hypothetical protein  98.44 
 
 
449 aa  895    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.122168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2153  hypothetical protein  38.46 
 
 
449 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4921  hypothetical protein  40.89 
 
 
450 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0718  hypothetical protein  35.28 
 
 
458 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.201396  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0099  hypothetical protein  38.64 
 
 
424 aa  293  5e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00564358  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0089  hypothetical protein  37.59 
 
 
424 aa  291  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.200818  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0094  hypothetical protein  37.78 
 
 
424 aa  289  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1988  hypothetical protein  36.67 
 
 
450 aa  288  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0133  hypothetical protein  36.53 
 
 
423 aa  286  5e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0121  hypothetical protein  36.59 
 
 
424 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00158567  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1920  hypothetical protein  38.44 
 
 
430 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2124  hypothetical protein  36.05 
 
 
424 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000234804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1638  hypothetical protein  37.5 
 
 
427 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0597  hypothetical protein  35.37 
 
 
442 aa  266  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0572  hypothetical protein  34.99 
 
 
442 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2667  hypothetical protein  34.92 
 
 
424 aa  264  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0707942  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_537  hypothetical protein  35.6 
 
 
442 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.781044  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2851  hypothetical protein  34.82 
 
 
445 aa  260  3e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0586103  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0110  hypothetical protein  34.51 
 
 
448 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.765018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0652  putative phosphatase  31.93 
 
 
433 aa  242  7.999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.49036  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1327  hypothetical protein  37.08 
 
 
412 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.964057  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3462  hypothetical protein  32.35 
 
 
435 aa  226  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0657  hypothetical protein  34.08 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1422  hypothetical protein  31.77 
 
 
422 aa  216  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3165  hypothetical protein  34.21 
 
 
443 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0143624  normal  0.30892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1747  hypothetical protein  34 
 
 
443 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.506846  hitchhiker  0.000552489 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1235  hypothetical protein  26.94 
 
 
406 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2018  hypothetical protein  32.51 
 
 
412 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.896322  normal  0.166706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2164  hypothetical protein  33.71 
 
 
454 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00681502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3031  hypothetical protein  33.63 
 
 
425 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5441  hypothetical protein  33.26 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1252  hypothetical protein  30.97 
 
 
426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.16322 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3259  hypothetical protein  28.09 
 
 
415 aa  149  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2985  hypothetical protein  27.77 
 
 
415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.767883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6064  hypothetical protein  30.16 
 
 
439 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.634375  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3021  hypothetical protein  27.09 
 
 
415 aa  146  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1990  hypothetical protein  27.31 
 
 
415 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2967  hypothetical protein  27.09 
 
 
415 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3292  hypothetical protein  27.09 
 
 
415 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2084  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0833724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3297  hypothetical protein  26.86 
 
 
415 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3319  hypothetical protein  26.86 
 
 
415 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3283  hypothetical protein  26.41 
 
 
415 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1004  hypothetical protein  25.96 
 
 
413 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00505199  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0847  hypothetical protein  24.55 
 
 
410 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3256  hypothetical protein  25.96 
 
 
413 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2276  hypothetical protein  25.9 
 
 
413 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2364  hypothetical protein  26.23 
 
 
413 aa  131  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1789  hypothetical protein  26.56 
 
 
413 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2349  hypothetical protein  24.89 
 
 
415 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.218384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2175  hypothetical protein  28.57 
 
 
407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2737  hypothetical protein  26.46 
 
 
413 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.601359  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0062  hypothetical protein  25.86 
 
 
418 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.519667  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0065  hypothetical protein  26.19 
 
 
418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1138  hypothetical protein  26 
 
 
413 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258981 
 
 
-
 
NC_002950  PG1280  hypothetical protein  25.33 
 
 
415 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4577  hypothetical protein  26.12 
 
 
411 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0647604  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3017  hypothetical protein  31.54 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0370734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1283  hypothetical protein  26.65 
 
 
412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000225003  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0704  hypothetical protein  25 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1926  hypothetical protein  28.12 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.570079  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0559  hypothetical protein  24.03 
 
 
410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.146499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3628  hypothetical protein  28.1 
 
 
404 aa  116  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.73345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1657  hypothetical protein  28.38 
 
 
411 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.962442 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0709  hypothetical protein  24.04 
 
 
410 aa  110  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000587987 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2042  hypothetical protein  24.15 
 
 
413 aa  108  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000173265  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0086  hypothetical protein  23.13 
 
 
411 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09523  hypothetical protein  23.44 
 
 
411 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.640574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2761  hypothetical protein  25.73 
 
 
404 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0009  hypothetical protein  24.22 
 
 
417 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2369  hypothetical protein  25 
 
 
420 aa  99.4  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2814  hypothetical protein  25.92 
 
 
404 aa  96.7  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3076  hypothetical protein  26.94 
 
 
277 aa  96.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2901  hypothetical protein  27.06 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2649  hypothetical protein  24.72 
 
 
418 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.804113  normal  0.316005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2995  hypothetical protein  26.61 
 
 
404 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1404  hypothetical protein  24.49 
 
 
406 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.413261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0135  hypothetical protein  25.17 
 
 
436 aa  89  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1282  hypothetical protein  23.25 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000228173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2554  hypothetical protein  23.42 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3152  hypothetical protein  29.91 
 
 
412 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2478  hypothetical protein  28.53 
 
 
374 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1859  hypothetical protein  20.76 
 
 
414 aa  57.4  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958241  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3890  hypothetical protein  26.65 
 
 
399 aa  43.5  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.282654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>