More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1494 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  99.21 
 
 
254 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  71.26 
 
 
254 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  49.17 
 
 
244 aa  246  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  52.3 
 
 
409 aa  244  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  49.58 
 
 
423 aa  244  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  52.72 
 
 
407 aa  244  9e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.24 
 
 
417 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  46.82 
 
 
649 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  51.05 
 
 
443 aa  238  5.999999999999999e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
411 aa  228  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  49.79 
 
 
870 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  51.6 
 
 
256 aa  227  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
390 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.06 
 
 
390 aa  226  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.67 
 
 
468 aa  225  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 
422 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.89 
 
 
247 aa  224  1e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  43.62 
 
 
488 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  47.78 
 
 
418 aa  223  3e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  43.83 
 
 
438 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
245 aa  222  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  52 
 
 
450 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  47.9 
 
 
418 aa  221  7e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  43.87 
 
 
428 aa  221  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  44.58 
 
 
425 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  44.73 
 
 
429 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.49 
 
 
449 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  44.49 
 
 
420 aa  219  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  41.31 
 
 
427 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  45.53 
 
 
416 aa  219  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  51 
 
 
422 aa  219  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  42.02 
 
 
472 aa  219  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  46.96 
 
 
420 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  45.42 
 
 
411 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  51.24 
 
 
447 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  43.98 
 
 
711 aa  218  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.08 
 
 
454 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  44.58 
 
 
435 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  46.86 
 
 
408 aa  218  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  45.96 
 
 
424 aa  218  8.999999999999998e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  50.24 
 
 
421 aa  217  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  41.83 
 
 
437 aa  217  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  51.6 
 
 
264 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  45.53 
 
 
429 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  45.68 
 
 
436 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  49.26 
 
 
428 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  42.86 
 
 
420 aa  215  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  47 
 
 
429 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
415 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  49.5 
 
 
427 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  46.69 
 
 
241 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  49.07 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
419 aa  213  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  47.29 
 
 
420 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  45.99 
 
 
605 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  44.92 
 
 
250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.72 
 
 
415 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  48 
 
 
369 aa  212  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  42.74 
 
 
247 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  48.62 
 
 
422 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.08 
 
 
432 aa  211  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  46.81 
 
 
424 aa  211  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  45.38 
 
 
493 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  46.69 
 
 
241 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  45.8 
 
 
246 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  44.68 
 
 
424 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  47.86 
 
 
400 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  44.58 
 
 
247 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  44.58 
 
 
247 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  43.75 
 
 
418 aa  209  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 
418 aa  210  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  49 
 
 
439 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  47.64 
 
 
433 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
405 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  47.34 
 
 
405 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  47.32 
 
 
433 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  44.67 
 
 
457 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  49.5 
 
 
418 aa  209  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  43.43 
 
 
435 aa  208  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  44.58 
 
 
411 aa  208  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  51 
 
 
428 aa  209  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  46.82 
 
 
429 aa  208  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  43.29 
 
 
429 aa  208  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
471 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
465 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
469 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  44.33 
 
 
419 aa  207  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
465 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
465 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
465 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  48.86 
 
 
395 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
465 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  44.68 
 
 
816 aa  206  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 
469 aa  206  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  44.49 
 
 
243 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  48.51 
 
 
446 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  44.73 
 
 
246 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  48.77 
 
 
456 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>