262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1490 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 371 aa  711    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  98.11 
 
 		 371 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  98.65 
 
 		 371 aa  701    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  68.46 
 
 		 370 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  31.82 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  30.43 
 
 		 382 aa  153  4e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  29.86 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  27.03 
 
 		 418 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  31.21 
 
 		 418 aa  129  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  30.71 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  29.83 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 792 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  29.63 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  28.75 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  31.7 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  30.4 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  25.27 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.5 
 
 		 403 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  31.7 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  30.45 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  29.65 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  31.9 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  30.57 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.82 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  26.63 
 
 		 379 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  29.69 
 
 		 389 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.53 
 
 		 394 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.13 
 
 		 365 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 356 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  30.06 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.01 
 
 		 364 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.61 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 423 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  30 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.35 
 
 		 388 aa  90.5  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 380 aa  90.5  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  31.74 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  30.87 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  27.13 
 
 		 379 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 442 aa  87.4  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  29.73 
 
 		 388 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  29.06 
 
 		 396 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  26.97 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  23.1 
 
 		 393 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  23.81 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  29.44 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  22.47 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  30.87 
 
 		 388 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 1040 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  25.47 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1019  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0982  permease YjgP/YjgQ family protein  24.51 
 
 		 371 aa  79.7  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1231  permease YjgP/YjgQ family protein  25.78 
 
 		 371 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192979  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0987  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 371 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  22.1 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  24.19 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  26.06 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  21.65 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  22.68 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0680  permease YjgP/YjgQ family protein  29.46 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.519951  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.04 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 391 aa  76.3  0.0000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.58 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 		 495 aa  75.9  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11670  permease YjgP/YjgQ family  27.59 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.29 
 
 		 391 aa  75.5  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  21.32 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0559  permease YjgP/YjgQ family protein  30.68 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.298895  hitchhiker  0.00000418027 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  29.03 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.74 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4236  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 371 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  26.35 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  28.31 
 
 		 478 aa  73.2  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  25.1 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0396  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.167769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  27.7 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  22.57 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  26.9 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  21.56 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  25 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  26.5 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  21.26 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  24.05 
 
 		 416 aa  69.7  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.02 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  22.51 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  28.44 
 
 		 386 aa  69.3  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  21.98 
 
 		 401 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.84 
 
 		 443 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0318  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 363 aa  69.3  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.341931 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2082  hypothetical protein  24.65 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000432404  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  21.12 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  24.87 
 
 		 384 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  24.41 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  23.37 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  31.9 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>