154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1468 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1468  HNH nuclease  100 
 
 
179 aa  356  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419266  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1371  HNH nuclease  87.71 
 
 
373 aa  317  7e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3119  HNH nuclease  83.02 
 
 
357 aa  273  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.134297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1563  HNH endonuclease  84.38 
 
 
362 aa  271  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.010402  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0904  HNH nuclease  80.23 
 
 
370 aa  271  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.590201  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3618  HNH nuclease  83.55 
 
 
368 aa  269  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4134  HNH nuclease  85.53 
 
 
361 aa  264  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.276334  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3430  HNH nuclease  84.77 
 
 
379 aa  263  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3349  HNH endonuclease  76.4 
 
 
368 aa  262  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.645482  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4076  HNH endonuclease  82.89 
 
 
407 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.39422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1342  HNH nuclease  81.53 
 
 
382 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.435035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1468  HNH nuclease  80.62 
 
 
362 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.09392  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4160  HNH nuclease  82.55 
 
 
358 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874339  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4159  HNH endonuclease  78.12 
 
 
334 aa  257  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.114592  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3494  HNH nuclease  82.78 
 
 
355 aa  257  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0908  HNH nuclease  77.38 
 
 
370 aa  256  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000130016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1255  HNH nuclease  78.26 
 
 
392 aa  255  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000145383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4185  HNH nuclease  82.24 
 
 
357 aa  254  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0859  HNH nuclease  80 
 
 
370 aa  247  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3934  HNH nuclease  79.74 
 
 
420 aa  246  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4018  HNH endonuclease  76.1 
 
 
357 aa  246  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4158  HNH nuclease  77.71 
 
 
359 aa  245  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3550  HNH nuclease  79.01 
 
 
416 aa  241  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00633328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1150  HNH nuclease  76.82 
 
 
374 aa  241  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4042  HNH endonuclease  82.12 
 
 
356 aa  229  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00210589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4259  HNH nuclease  61.64 
 
 
346 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4239  HNH endonuclease  57.62 
 
 
372 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4262  HNH endonuclease  55.03 
 
 
372 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0816  HNH endonuclease  52.98 
 
 
355 aa  160  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.266631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4129  HNH endonuclease  55.19 
 
 
386 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4128  HNH endonuclease  55.97 
 
 
334 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2900  HNH endonuclease  51.66 
 
 
336 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0011728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3987  HNH endonuclease  50.85 
 
 
359 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4099  HNH endonuclease  55.48 
 
 
384 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4281  HNH endonuclease  51.52 
 
 
357 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2115  HNH endonuclease  51.3 
 
 
322 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1760  HNH endonuclease  50 
 
 
387 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1700  HNH endonuclease  39.62 
 
 
388 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00106635  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0411  HNH endonuclease  40.37 
 
 
391 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.732707 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3850  HNH endonuclease  38.95 
 
 
461 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1449  HNH endonuclease  40.13 
 
 
391 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.964003  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3075  HNH endonuclease  37.93 
 
 
391 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00244275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3791  HNH endonuclease  39.47 
 
 
362 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.352304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3400  HNH endonuclease  38.51 
 
 
390 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00340791  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0998  HNH endonuclease  38.36 
 
 
387 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.638291  normal  0.453877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3039  HNH endonuclease  39.74 
 
 
309 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.572998  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3198  HNH endonuclease  37.79 
 
 
388 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4158  HNH endonuclease  38.82 
 
 
388 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0493415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1332  HNH endonuclease  38.27 
 
 
264 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146487  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1431  HNH endonuclease  37.89 
 
 
388 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.535031  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1300  HNH endonuclease  38.96 
 
 
316 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.409984  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0450  HNH endonuclease  39.24 
 
 
390 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.480855 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1632  HNH endonuclease  38.61 
 
 
388 aa  98.2  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437118  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1516  HNH endonuclease  35.84 
 
 
390 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000144845  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0344  HNH endonuclease  48.08 
 
 
188 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557879  normal  0.69024 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0451  hypothetical protein  42.55 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.446853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2146  hypothetical protein  37.19 
 
 
414 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.0437716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0461  HNH endonuclease  45.59 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0161278  hitchhiker  0.0046419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  46.27 
 
 
560 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1335  HNH endonuclease  34.34 
 
 
321 aa  64.3  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  41.1 
 
 
177 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0876  HNH nuclease  44.94 
 
 
218 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1269  HNH endonuclease domain-containing protein  36.76 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000309683  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1080  HNH endonuclease  26.61 
 
 
228 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0178518  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  44.07 
 
 
169 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0855  HNH endonuclease  38.24 
 
 
230 aa  54.3  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000164704  hitchhiker  0.000000000578298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  41.54 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_004310  BR1643  HNH endonuclease family protein  39.39 
 
 
190 aa  52  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1591  HNH endonuclease family protein  39.39 
 
 
190 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.301685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  41.82 
 
 
171 aa  52  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  36.47 
 
 
186 aa  51.6  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  43.33 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1013  HNH endonuclease  36.49 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0063565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1272  HNH endonuclease  39.39 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3843  HNH endonuclease  36 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  37.65 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3103  HNH endonuclease  36.71 
 
 
189 aa  49.7  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.220092 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4001  hypothetical protein  34.72 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  36.84 
 
 
174 aa  48.9  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1327  HNH endonuclease  36.05 
 
 
186 aa  48.5  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.102116  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2524  HNH endonuclease  34.72 
 
 
216 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.434338 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  41.18 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  41.18 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  41.18 
 
 
182 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  39.73 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  36.36 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0579  HNH endonuclease  48.08 
 
 
123 aa  47  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  43.14 
 
 
166 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  33.82 
 
 
186 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0745  HNH endonuclease  34.85 
 
 
191 aa  47  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  34.85 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1686  HNH endonuclease  29.25 
 
 
163 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3490  HNH endonuclease  34.85 
 
 
185 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3846  HNH endonuclease  33.33 
 
 
185 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.895408  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3553  HNH endonuclease  33.33 
 
 
185 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.367592  normal  0.45905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  34.85 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  35.82 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3241  HNH endonuclease  36.36 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118071  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  32.26 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  38.24 
 
 
183 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>