289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1409 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1409  preprotein translocase, YajC subunit  100 
 
 
115 aa  228  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2541  protein translocase subunit yajC  99.13 
 
 
115 aa  227  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.170087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1308  preprotein translocase, YajC subunit  98.26 
 
 
115 aa  225  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.508947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1322  preprotein translocase, YajC subunit  79.31 
 
 
116 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2055  preprotein translocase, YajC subunit  53.41 
 
 
102 aa  87  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.34976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1765  protein translocase subunit yajC  36.89 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.242653  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1417  preprotein translocase, YajC subunit  45.56 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.718681  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1900  protein translocase subunit yajC  38.71 
 
 
113 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.257956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0845  preprotein translocase, YajC subunit  38.1 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000092041  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0806  preprotein translocase, YajC subunit  40.78 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0248725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1930  preprotein translocase, YajC subunit  41.98 
 
 
111 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2526  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
109 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1817  protein translocase subunit yajC  41.98 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0910437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0700  preprotein translocase subunit YajC  39.18 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1083  protein translocase subunit yajC  48 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.452709  normal  0.0755092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3991  preprotein translocase subunit YajC  40.22 
 
 
120 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340437  normal  0.209525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0995  protein translocase subunit yajC  46.84 
 
 
94 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2074  protein translocase subunit yajC  37.78 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3279  preprotein translocase subunit YajC  47.3 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.198543  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1790  preprotein translocase, YajC subunit  40.22 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.645433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2298  preprotein translocase, YajC subunit  39.25 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000341875  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0455  preprotein translocase, YajC subunit  42.22 
 
 
109 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0666222  normal  0.0413698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1217  protein translocase subunit yajC  38.89 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.38734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1797  protein translocase subunit yajC  43.33 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.188227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0542  preprotein translocase, YajC subunit  47.3 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0292946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0443  preprotein translocase, YajC subunit  43.33 
 
 
108 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0153138  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1783  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000873095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2434  preprotein translocase, YajC subunit  42.11 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.966428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1717  preprotein translocase, YajC subunit  36.73 
 
 
106 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.51746  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3035  preprotein translocase, YajC subunit  34.69 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0157  hypothetical protein  39.81 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4407  protein translocase subunit yajC  33.66 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.201974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1218  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000169115  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2665  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.423387 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1860  preprotein translocase subunit  42.47 
 
 
105 aa  72.4  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529455  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3809  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0636  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0237  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0689  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367207  normal  0.660097 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0611  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0721  preprotein translocase subunit YajC  36.84 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0147  preprotein translocase, YajC subunit  40 
 
 
101 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000391893  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0276  protein translocase subunit yajC  40.74 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.865381  normal  0.0326765 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4308  preprotein translocase, YajC subunit  38.3 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1340  preprotein translocase, YajC subunit  37.89 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.497494  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0343  preprotein translocase, YajC subunit  36.71 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.23698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1798  preprotein translocase, YajC subunit  32.73 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.225845  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2714  preprotein translocase subunit YajC  43.59 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.191333 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1770  preprotein translocase subunit, YajC  32.26 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.131308  decreased coverage  0.00406868 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1277  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1164  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0302  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2386  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2958  preprotein translocase subunit YajC  44.16 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2572  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.933871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3372  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3329  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.211385  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2548  preprotein translocase subunit YajC  44.16 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0861289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2010  preprotein translocase, YajC subunit  43.66 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.798178  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3363  preprotein translocase subunit YajC  37.5 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1507  preprotein translocase, YajC subunit  39.74 
 
 
108 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0853  protein translocase subunit yajC  38.1 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1173  preprotein translocase, YajC subunit  35.45 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441411  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2458  protein translocase subunit yajC  37.76 
 
 
117 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.107187  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1983  hypothetical protein  39.47 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1978  hypothetical protein  39.47 
 
 
111 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2213  preprotein translocase, YajC subunit  35.71 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00866418  normal  0.209417 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2348  preprotein translocase, YajC subunit  33.64 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1403  preprotein translocase, YajC subunit  42.17 
 
 
109 aa  67.4  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0149317 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3408  preprotein translocase subunit YajC  51.47 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.327995  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3109  preprotein translocase, YajC subunit  36.08 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.173268 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2945  preprotein translocase subunit YajC  42.86 
 
 
108 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2337  preprotein translocase, YajC subunit  38.82 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.539902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1893  preprotein translocase, YajC subunit  39.76 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.49225e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0523  preprotein translocase, YajC subunit  36.56 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2618  preprotein translocase, YajC subunit  38.27 
 
 
106 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0886  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1452  protein translocase subunit yajC  36.9 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0680  preprotein translocase, YajC subunit  37.86 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0730138  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2112  preprotein translocase, YajC subunit  37.38 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000210725  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_004310  BR0890  preprotein translocase, YajC subunit  36.47 
 
 
113 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1697  preprotein translocase, YajC subunit  40.96 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2809  preprotein translocase subunit YajC  41.56 
 
 
108 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0513  protein translocase subunit yajC  42.11 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2183  preprotein translocase, YajC subunit  38.55 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2646  preprotein translocase, YajC subunit  44.78 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808918  hitchhiker  0.00137205 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1115  preprotein translocase, YajC subunit  34.69 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.242644  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0534  preprotein translocase, YajC subunit  36.17 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1616  preprotein translocase subunit YajC  42.67 
 
 
114 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0558559  normal  0.288697 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4645  protein translocase subunit yajC  35 
 
 
91 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2777  preprotein translocase, YajC subunit  31.4 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.209285  normal  0.314245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1799  preprotein translocase, YajC subunit  41.03 
 
 
107 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.675653  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1495  preprotein translocase, YajC subunit  28.32 
 
 
115 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.528936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2854  preprotein translocase, YajC subunit  37.18 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3173  preprotein translocase, YajC subunit  33.75 
 
 
146 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.407254  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1274  preprotein translocase, YajC subunit  37.23 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0219  preprotein translocase, YajC subunit  36.19 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.780199  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2067  preprotein translocase, YajC subunit  44.74 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1622  preprotein translocase, YajC subunit  40.3 
 
 
91 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3867  preprotein translocase, YajC subunit  36.25 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>