62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1394 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1394  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
294 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0782856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1293  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
294 aa  588  1e-167  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.964954  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2555  hypothetical protein  97.11 
 
 
277 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.338009  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1308  hypothetical protein  88.44 
 
 
294 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.832333  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0723  hypothetical protein  39.52 
 
 
310 aa  148  1e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0286471 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0099  hypothetical protein  39.05 
 
 
310 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.892669  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  52.14 
 
 
456 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1195  hypothetical protein  39.05 
 
 
310 aa  145  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4591  hypothetical protein  33.56 
 
 
446 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.89176  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0788  hypothetical protein  36.56 
 
 
310 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1780  hypothetical protein  50.34 
 
 
443 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1053  hypothetical protein  44.44 
 
 
197 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.593896  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1317  protein of unknown function DUF147  48.92 
 
 
649 aa  134  1e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.521946  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  44.9 
 
 
288 aa  131  1e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0839  hypothetical protein  43.95 
 
 
270 aa  129  7e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.286364  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1616  putative PAS/PAC sensor protein  44.29 
 
 
559 aa  128  1e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.477909  normal  0.117342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1389  hypothetical protein  40.29 
 
 
293 aa  127  2e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0634969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0504  protein of unknown function DUF147  34.39 
 
 
270 aa  125  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  43.07 
 
 
291 aa  125  8e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2466  protein of unknown function DUF147  36.36 
 
 
270 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1210  putative PAS/PAC sensor protein  35.03 
 
 
540 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0526078  normal  0.0174457 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0301  protein of unknown function DUF147  35.78 
 
 
268 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0317825  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1442  protein of unknown function DUF147  33.49 
 
 
269 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1944  protein of unknown function DUF147  45.14 
 
 
265 aa  122  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0381023  normal  0.0659541 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2246  protein of unknown function DUF147  41.96 
 
 
269 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.217243 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0489  hypothetical protein  39.07 
 
 
268 aa  114  2e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3381  hypothetical protein  44.74 
 
 
195 aa  109  7e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.270651 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0075  protein of unknown function DUF147  35.86 
 
 
265 aa  93.2  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.104264  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  36.78 
 
 
259 aa  58.2  2e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  44.12 
 
 
269 aa  55.1  1e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  41.18 
 
 
248 aa  54.7  2e-06  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  1.63488e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  36.14 
 
 
258 aa  51.6  1e-05  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  44 
 
 
277 aa  52  1e-05  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  38.89 
 
 
282 aa  50.4  3e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.08276e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  35.71 
 
 
275 aa  50.1  5e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  41.98 
 
 
292 aa  49.3  7e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  34.67 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  29.03 
 
 
279 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  35.8 
 
 
382 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  39.71 
 
 
388 aa  46.6  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  1.36651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  37.8 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  4.24846e-09  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2254  hypothetical protein  33.73 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  35.29 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  39.76 
 
 
288 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  43.94 
 
 
285 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3222  hypothetical protein  36.59 
 
 
282 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  38.24 
 
 
272 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  44 
 
 
277 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1764  hypothetical protein  38.24 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  35.29 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  36.76 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  28.8 
 
 
270 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  38.24 
 
 
275 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  41.18 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  25.31 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  38.89 
 
 
480 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  37.04 
 
 
388 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  40 
 
 
252 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2672  protein of unknown function DUF147  40.91 
 
 
273 aa  43.1  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  41.25 
 
 
249 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  36.11 
 
 
273 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  6.02517e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  39.76 
 
 
483 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>