More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1230 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  56.39 
 
 		 883 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  53.34 
 
 		 986 aa  688    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  53.94 
 
 		 892 aa  650    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 		 949 aa  661    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  53.19 
 
 		 980 aa  686    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  53.74 
 
 		 1058 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  55.27 
 
 		 947 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 1079 aa  664    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 951 aa  1869    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  55.63 
 
 		 884 aa  687    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  54.57 
 
 		 984 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  53.24 
 
 		 903 aa  653    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 		 997 aa  665    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  79.88 
 
 		 970 aa  1410    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  40.66 
 
 		 882 aa  644    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  42.04 
 
 		 962 aa  677    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  44.7 
 
 		 882 aa  686    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 		 692 aa  629  1e-179  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  54.04 
 
 		 971 aa  624  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  53.57 
 
 		 822 aa  624  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  53.1 
 
 		 1161 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  47.01 
 
 		 888 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  53.54 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  53.63 
 
 		 940 aa  618  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  52.85 
 
 		 732 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  49.54 
 
 		 884 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  49.23 
 
 		 1029 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 985 aa  615  9.999999999999999e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.38 
 
 		 898 aa  610  1e-173  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  49.92 
 
 		 1011 aa  610  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  52.67 
 
 		 984 aa  609  1e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 881 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3628  translation initiation factor IF-2  52.04 
 
 		 887 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.206324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 885 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 		 897 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  52.24 
 
 		 884 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 		 968 aa  600  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 896 aa  600  1e-170  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  51.81 
 
 		 992 aa  600  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2820  translation initiation factor IF-2  54.14 
 
 		 868 aa  600  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2689  translation initiation factor IF-2  54.31 
 
 		 868 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  0.0000000000185319 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  48.08 
 
 		 907 aa  600  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  51.44 
 
 		 894 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  53.98 
 
 		 845 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  52.41 
 
 		 880 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 896 aa  599  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.23 
 
 		 882 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 896 aa  598  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.44 
 
 		 964 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  597  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  52.35 
 
 		 689 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000966946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  0.0000041871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 885 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  52.14 
 
 		 889 aa  597  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000967139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0555  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 875 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.218131  normal  0.382755 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3554  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3572  translation initiation factor IF-2  51.78 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3911  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  51.54 
 
 		 894 aa  594  1e-168  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0598  translation initiation factor IF-2  50.86 
 
 		 891 aa  594  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.223745  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1864  translation initiation factor IF-2  53.2 
 
 		 876 aa  595  1e-168  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2134  translation initiation factor IF-2  53.7 
 
 		 978 aa  595  1e-168  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149988  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  51.88 
 
 		 902 aa  593  1e-168  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0821  translation initiation factor IF-2  53.89 
 
 		 831 aa  595  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.175155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  52.5 
 
 		 953 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0391  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 		 875 aa  594  1e-168  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 686 aa  592  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  51.38 
 
 		 889 aa  592  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3664  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1034  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 		 774 aa  589  1e-167  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 943 aa  590  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0725  translation initiation factor IF-2  51.9 
 
 		 912 aa  591  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0457048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000141928  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2120  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 845 aa  589  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0599462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3950  translation initiation factor IF-2  51.61 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.373868  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  52.25 
 
 		 895 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 976 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1333  translation initiation factor IF-2  51.6 
 
 		 688 aa  592  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0112644  hitchhiker  0.000569775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 		 989 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2295  translation initiation factor IF-2  50.17 
 
 		 886 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0792369 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  53.53 
 
 		 975 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1047  translation initiation factor IF-2  50.33 
 
 		 1053 aa  590  1e-167  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  52.32 
 
 		 943 aa  590  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  51.82 
 
 		 943 aa  588  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 975 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3635  translation initiation factor IF-2  52.17 
 
 		 688 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0196676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2426  translation initiation factor IF-2  51.79 
 
 		 968 aa  589  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0271781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  42.82 
 
 		 964 aa  588  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1948  translation initiation factor IF-2  51.2 
 
 		 883 aa  587  1e-166  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0536071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 971 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 971 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.36 
 
 		 971 aa  587  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3346  translation initiation factor IF-2  52.84 
 
 		 901 aa  588  1e-166  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.12411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>