More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1206 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1078  lysyl-tRNA synthetase  98.64 
 
 		 513 aa  1014    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1117  lysyl-tRNA synthetase  83.79 
 
 		 520 aa  848    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.462738  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 513 aa  1025    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 513 aa  1025    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  53 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 489 aa  503  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 492 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  51.79 
 
 		 504 aa  498  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 494 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 492 aa  496  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  52.6 
 
 		 492 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  52.3 
 
 		 503 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0117  lysyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000338438  hitchhiker  0.00843463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 494 aa  490  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  48.69 
 
 		 494 aa  488  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3150  lysyl-tRNA synthetase  50.98 
 
 		 561 aa  488  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000153086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 499 aa  486  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0345  lysyl-tRNA synthetase  51.35 
 
 		 573 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2415  lysyl-tRNA synthetase  51.67 
 
 		 504 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0221722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  46.86 
 
 		 499 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  50.4 
 
 		 502 aa  479  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 499 aa  481  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.407963  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 		 501 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 488 aa  478  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0209  lysyl-tRNA synthetase  50.3 
 
 		 495 aa  476  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000164497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 561 aa  475  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  47.6 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0750  lysyl-tRNA synthetase  48.89 
 
 		 496 aa  473  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0384  lysyl-tRNA synthetase  50.39 
 
 		 509 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.808438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 532 aa  472  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  50.2 
 
 		 508 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 		 503 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 497 aa  468  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0075  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0076  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0629827  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0072  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0072  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.172835  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  48.81 
 
 		 494 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0085  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000436352 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0076  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 490 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0088  lysyl-tRNA synthetase  47.48 
 
 		 499 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.863253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0072  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0883  lysyl-tRNA synthetase  48.73 
 
 		 573 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0084  lysyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 499 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.016168  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0175  lysyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 		 510 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0417  lysyl-tRNA synthetase  48.28 
 
 		 494 aa  467  9.999999999999999e-131  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.904038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0856  lysyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 573 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5232  lysyl-tRNA synthetase  46.88 
 
 		 499 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0118491  hitchhiker  0.00000000172197 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1957  lysyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 		 513 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  46.89 
 
 		 515 aa  464  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 495 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  51.2 
 
 		 496 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 499 aa  461  9.999999999999999e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  47.42 
 
 		 493 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  50.59 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3556  lysyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000444514  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0893  lysyl-tRNA synthetase, class-2  48.12 
 
 		 501 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2238  lysyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 647 aa  458  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000093194  normal  0.362438 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2847  lysyl-tRNA synthetase  50.51 
 
 		 484 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0733  lysyl-tRNA synthetase  47.88 
 
 		 496 aa  458  1e-127  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.874449  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0538  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000249001  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  48.59 
 
 		 499 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0110  lysyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 502 aa  455  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.296046 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2275  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1034  lysyl-tRNA synthetase  47.35 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1642  lysyl-tRNA synthetase  48.23 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.573049  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0271  lysyl-tRNA synthetase  47.68 
 
 		 508 aa  448  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000549631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0396  lysyl-tRNA synthetase  49.33 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0797  lysyl-tRNA synthetase  47.36 
 
 		 509 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0164991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 505 aa  451  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0302  lysyl-tRNA synthetase  49.9 
 
 		 523 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1741  hypothetical protein  47.51 
 
 		 496 aa  446  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1741  hypothetical protein  47.32 
 
 		 496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  46.69 
 
 		 506 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01841  lysyl-tRNA synthetase  49.13 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 508 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0551  lysyl-tRNA synthetase  45.79 
 
 		 498 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1739  lysyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 		 509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.326281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1028  lysyl-tRNA synthetase  46.94 
 
 		 510 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.296051  normal  0.894371 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2848  lysyl-tRNA synthetase  46.23 
 
 		 501 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0726  lysyl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 507 aa  445  1e-123  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 516 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  47.07 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32202  predicted protein  48.98 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.334711  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0154  lysyl-tRNA synthetase  50.6 
 
 		 502 aa  445  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_517  lysyl-tRNA synthetase (class II)  45.67 
 
 		 498 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.152204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>