More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1120 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  100 
 
 
389 aa  767    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3266  ATPase AAA-5  79.57 
 
 
382 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.580466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0230  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.51 
 
 
375 aa  266  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1237  putative regulatory protein  42.46 
 
 
506 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1702  ATPase  46.1 
 
 
509 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.383642  normal  0.0523367 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2921  ATPase  46.07 
 
 
489 aa  235  8e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.794922  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1812  ATPase  45.07 
 
 
509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0331126 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3329  MoxR-related protein  45.49 
 
 
498 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.271862  normal  0.0441564 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0583  hypothetical protein  39.22 
 
 
546 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.998789  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1893  ATPase  45.36 
 
 
464 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103077 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0005  regulatory ATPase RavA  42.61 
 
 
512 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.016355  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3511  MoxR-like ATPase  47.83 
 
 
466 aa  202  6e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0100798  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4212  regulatory ATPase RavA  42.61 
 
 
512 aa  202  6e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4903  regulatory ATPase RavA  41.72 
 
 
523 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.036099  hitchhiker  0.000827592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0005  regulatory ATPase RavA  42.61 
 
 
512 aa  202  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33673  predicted protein  44.36 
 
 
547 aa  202  9e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.229173  normal  0.12598 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3980  regulatory ATPase RavA  39.86 
 
 
499 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4243  regulatory ATPase RavA  41.4 
 
 
499 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4533  regulatory ATPase RavA  41.4 
 
 
499 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.991021  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03630  fused predicted transcriptional regulator: sigma54 activator protein/conserved protein  41.09 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4221  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  40.79 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3962  regulatory ATPase RavA  41.09 
 
 
506 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4248  regulatory ATPase RavA  41.09 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0104649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4114  regulatory ATPase RavA  40.73 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972847  normal  0.113412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4262  regulatory ATPase RavA  41.09 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.966973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03574  hypothetical protein  41.09 
 
 
498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5182  regulatory ATPase RavA  40.73 
 
 
498 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0691971  normal  0.286822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4180  regulatory ATPase RavA  41.35 
 
 
498 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2515  ATPase associated with various cellular activities  37.67 
 
 
530 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152961  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4212  regulatory ATPase RavA  40.43 
 
 
498 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.390449  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4162  regulatory ATPase RavA  40.43 
 
 
498 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4175  regulatory ATPase RavA  42.19 
 
 
468 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4118  regulatory ATPase RavA  41.29 
 
 
498 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.428574  normal  0.0179625 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4091  regulatory ATPase RavA  40.43 
 
 
498 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4271  regulatory ATPase RavA  40.43 
 
 
498 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.64828  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4106  regulatory ATPase RavA  40.07 
 
 
498 aa  193  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0538365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2706  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.46 
 
 
477 aa  190  4e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.055583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0704  hypothetical protein  37.86 
 
 
552 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000048  putative regulator protein  39.37 
 
 
553 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2809  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.53 
 
 
526 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000130011  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05670  hypothetical protein  38.68 
 
 
553 aa  181  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  34.71 
 
 
560 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4815  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  36.21 
 
 
407 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.498459  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0668  ATPase  33.42 
 
 
390 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00327947 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.25 
 
 
382 aa  176  6e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0964  Pyrrolo-quinoline quinone  34.05 
 
 
543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1378  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  37.9 
 
 
436 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0059  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  31.91 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000794981  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1695  ATPase  36.7 
 
 
376 aa  157  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.122813  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0360  ATPase  44.58 
 
 
368 aa  155  1e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0193  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  35.62 
 
 
387 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1823  ATPase  42.77 
 
 
368 aa  149  7e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0297  ATPase  41.34 
 
 
368 aa  149  8e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5828  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  34.92 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.205285  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0981  ATPase  41.57 
 
 
368 aa  145  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000155224 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1086  ATPase  39.16 
 
 
379 aa  140  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.631223  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1428  ATPase  27.64 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0170054  hitchhiker  0.00214 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  27.84 
 
 
309 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  27.84 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2754  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.84 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00295405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  26.67 
 
 
309 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2803  hypothetical protein  27.59 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3014  hypothetical protein  27.59 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0435671 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3016  hypothetical protein  27.59 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  26.32 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3053  hypothetical protein  27.59 
 
 
309 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.631245  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2735  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.15 
 
 
309 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4480  ATPase  29.33 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.290117  hitchhiker  0.00475786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.42 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  27.24 
 
 
335 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1736  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.28 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0658349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1459  ATPase  28.28 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.0369744 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  30.4 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  27.88 
 
 
303 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3635  ATPase  28.66 
 
 
334 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  28 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.97 
 
 
350 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.41 
 
 
318 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  29.18 
 
 
316 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2792  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.46 
 
 
336 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258088 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3056  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.11 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0112658 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  27.51 
 
 
335 aa  71.2  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0203  ATPase  28.52 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.526307 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  26.87 
 
 
309 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0369  ATPase  28.99 
 
 
336 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.536923  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0683  AAA_3 ATPase  27.27 
 
 
335 aa  70.9  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.557098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1376  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.59 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.875215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  26.53 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  26.43 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2844  ATPase  27.24 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.210737  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  27.8 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2948  ATPase  28.87 
 
 
333 aa  69.7  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.343803  normal  0.69652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1456  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.61 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151818  normal  0.294697 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2234  ATPase  29.15 
 
 
349 aa  69.7  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1024  putative MoxR family protein  28.73 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2685  ATPase  28.73 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.452086  normal  0.63009 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0928  ATPase  24.91 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  25.46 
 
 
315 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0916  ATPase  28.36 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192852  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2108  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.73 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>