108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1107 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 410 aa  826    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  37.11 
 
 		 399 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1934  hypothetical protein  31.66 
 
 		 386 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.671247  normal  0.125283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0265  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1805  XRE family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  28.01 
 
 		 342 aa  91.3  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1957  XRE family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.63284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4388  helix-turn-helix domain-containing protein  26.17 
 
 		 355 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  25.71 
 
 		 347 aa  84.3  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  26.79 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4039  helix-turn-helix domain-containing protein  26.19 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0527  hypothetical protein  26.94 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1365  helix-turn-helix domain-containing protein  25.83 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 346 aa  71.6  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  25.45 
 
 		 355 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  32.28 
 
 		 174 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0389  hypothetical protein  24.74 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0725053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2466  protein of unknown function DUF955  23.98 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000413379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1489  protein of unknown function DUF955  23.16 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  30.6 
 
 		 160 aa  60.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0095  protein of unknown function DUF955  24.76 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0034  zinc-related peptidase  20.95 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000203877  decreased coverage  0.0000849316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  31.16 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0686  helix-turn-helix domain protein  25.57 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0820462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2981  helix-turn-helix domain-containing protein  26.1 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0300  helix-turn-helix domain-containing protein  29.01 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193502  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4250  DNA-binding protein  24.76 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 152 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1625  hypothetical protein  26.03 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 72 aa  53.1  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  23.49 
 
 		 255 aa  53.1  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  25.68 
 
 		 251 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0127  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 111 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0101  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000391644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0299  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 71 aa  51.2  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000289962  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2629  helix-turn-helix domain protein  25.45 
 
 		 359 aa  51.2  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000486694  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0823  helix-turn-helix domain-containing protein  23.12 
 
 		 367 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3468  helix-turn-helix domain protein  23.42 
 
 		 367 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2168  protein of unknown function DUF955  25.13 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  25 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1951  helix-turn-helix domain-containing protein  24.77 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1853  hypothetical protein  24.38 
 
 		 260 aa  49.7  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.163672  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2342  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000474992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3160  protein of unknown function DUF955  26.46 
 
 		 404 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.208418  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1733  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3331  putative transcription regulator protein  45.31 
 
 		 94 aa  48.5  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  23.28 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  27.61 
 
 		 261 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1819  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 69 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.344657  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 137 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  41.94 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  29.46 
 
 		 182 aa  47  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  45.31 
 
 		 151 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  33.64 
 
 		 221 aa  46.6  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  31.2 
 
 		 227 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 268 aa  46.6  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2003  Zn peptidase-like protein  26.2 
 
 		 286 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2542  transcriptional regulator, XRE family  35.44 
 
 		 116 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.054294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1878  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 70 aa  46.2  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 128 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3570  hypothetical protein  26.45 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.854766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 142 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 142 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02310  hypothetical protein  25.76 
 
 		 349 aa  45.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  39.68 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 76 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1890  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 120 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00515298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  35.38 
 
 		 115 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3355  hypothetical protein  27.42 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160143  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1649  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 69 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287153  hitchhiker  0.00253502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1588  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266201  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.36 
 
 		 200 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  41.94 
 
 		 128 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  26.79 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2370  transcriptional regulator, XRE family  60.61 
 
 		 72 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0073  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0074  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0070  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0070  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3250  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  39.68 
 
 		 189 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.653673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0074  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 495 aa  44.3  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 		 117 aa  44.3  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0086  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.786766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3871  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 72 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0083  DNA-binding protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440854 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3920  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 72 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00000806628  normal  0.211868 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0632  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 		 71 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000285782  unclonable  0.0000000000746668 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1416  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 77 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239445  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  42.11 
 
 		 233 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 380 aa  43.9  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 145 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 134 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0625  XRE family transcriptional regulator  55 
 
 		 108 aa  43.5  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000512612 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>