236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1089 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_1027  transporter  98.91 
 
 		 366 aa  693    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1089  permease  100 
 
 		 366 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3647  permease  80 
 
 		 364 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.5727 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2282  permease  66.36 
 
 		 330 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.954207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3673  permease  64.35 
 
 		 351 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1707  permease  60.74 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3722  permease-like  61.68 
 
 		 381 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4062  permease  65.85 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.78082  normal  0.984142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2777  permease-like  60.33 
 
 		 363 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1783  permease  62.75 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0049  permease  64.43 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0265  permease  60.76 
 
 		 367 aa  423  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.803514 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4600  permease  62.24 
 
 		 345 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3942  permease  65.63 
 
 		 354 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2844  permease  66.67 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693493  normal  0.0127415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3620  permease  60.95 
 
 		 351 aa  403  1e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3641  permease  61.92 
 
 		 348 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3419  permease  65.02 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1474  permease  62.7 
 
 		 353 aa  392  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.614025  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2949  permease  65.88 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1704  hypothetical protein  62.82 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.91407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3415  permease  62.54 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1935  permease  62.43 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4202  transporter  60.29 
 
 		 352 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1645  permease  62.72 
 
 		 350 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.701842  normal  0.852279 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2023  permease  60.56 
 
 		 350 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0464  permease  62.62 
 
 		 350 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000958774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0507  permease  54.87 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1117  permease  56.93 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.107708 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0398  hypothetical protein  60.39 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.679708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1178  permease  57.19 
 
 		 315 aa  362  8e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0438  permease  54.95 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4076  permease  64.87 
 
 		 349 aa  349  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0164237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1875  permease  55.59 
 
 		 315 aa  348  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2955  hypothetical protein  56.51 
 
 		 315 aa  346  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0519  permease  56.19 
 
 		 315 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0857  permease  56.41 
 
 		 315 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.398013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2196  permease  54.63 
 
 		 317 aa  328  6e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000111416  normal  0.407571 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2555  permease  51.94 
 
 		 349 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000127833  hitchhiker  0.00212732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2181  permease  49.84 
 
 		 319 aa  322  7e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000463978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2640  permease  46.37 
 
 		 323 aa  309  5e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2566  permease  50.8 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.931351 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1709  hypothetical protein  46.65 
 
 		 323 aa  305  6e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00218353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1427  putative permease  51.76 
 
 		 322 aa  301  8.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0548  permease  47.74 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000695477  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0153  hypothetical protein  44.41 
 
 		 323 aa  295  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0934  permease  45.37 
 
 		 319 aa  295  9e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00064116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0110  permease  47.59 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3659  permease  46.24 
 
 		 349 aa  286  5e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1870  permease  44.59 
 
 		 319 aa  278  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.788351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3958  permease  41.38 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0534  permease  41.69 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3497  permease  41.69 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3190  permease  40.5 
 
 		 335 aa  276  5e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0492  permease  41.38 
 
 		 331 aa  275  7e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3832  permease  41.07 
 
 		 331 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2048  permease  40.38 
 
 		 336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1223  permease  42.63 
 
 		 334 aa  272  5.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3776  permease  41.07 
 
 		 331 aa  272  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0535  hypothetical protein  41.69 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4014  permease  44.65 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0335  permease  45.03 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.943617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2333  permease  39.44 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.685877  normal  0.0887616 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3818  permease  39.44 
 
 		 332 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1221  permease  38.2 
 
 		 332 aa  265  7e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5316  permease  41.37 
 
 		 354 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.465068  normal  0.121906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0751  permease  45.83 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1204  permease  45.05 
 
 		 318 aa  262  6e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0819  permease  45.19 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.350869  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1408  permease  45.75 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0728  permease  42.11 
 
 		 353 aa  259  6e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1828  permease  37.81 
 
 		 330 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22223  normal  0.735803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1725  permease  38.46 
 
 		 337 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1092  permease  43.81 
 
 		 337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000361743  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3357  putative permease  37.42 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.138974  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1810  permease  38.44 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0731  permease  43.42 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000936228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1442  permease  38.72 
 
 		 371 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2565  permease  40.07 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000010966  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0486  permease  37.92 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1066  permease  45.51 
 
 		 337 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1299  permease  40.4 
 
 		 338 aa  231  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.201061  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4283  permease  42.62 
 
 		 337 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0589  permease  36.25 
 
 		 332 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0849  permease  35.2 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000568724 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1109  permease  38.93 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1430  permease  38.68 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.611447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0864  permease  36.21 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.569206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0015  permease  35.25 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.684774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3427  permease  29.74 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000478015  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0966  permease  31.27 
 
 		 311 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000479758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2503  permease  36.11 
 
 		 318 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.523202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1217  permease  29.63 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2452  putative permease  30.95 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08200  permease  29.82 
 
 		 345 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000119775  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2516  permease  29.41 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.114382  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02580  hypothetical protein  30.12 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01499  hypothetical protein  30.12 
 
 		 345 aa  157  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2425  hypothetical protein  31.32 
 
 		 294 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.395757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1498  permease  30.87 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.562403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>