102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1088 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1026  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  99.57 
 
 
232 aa  427  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1088  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
232 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4015  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  66.67 
 
 
234 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3646  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  65.37 
 
 
232 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.489935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4058  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  47.41 
 
 
231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.477515  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2887  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.1 
 
 
236 aa  125  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2782  hypothetical protein  37.68 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1909  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  40.85 
 
 
234 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00531601  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3605  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.23 
 
 
225 aa  115  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2546  membrane protein  27.36 
 
 
230 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0628  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.98 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517911  decreased coverage  0.00174403 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3823  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
246 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.367359  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2958  thiol:disulfide interchange protein, putative  34.62 
 
 
228 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4120  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.37 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2861  membrane protein  27.86 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.563665  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4081  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.37 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3675  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.18 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4996  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.98 
 
 
253 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0989  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.09 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.23416  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18581  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.09 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.236803  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0434  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.95 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0151  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.74 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0516  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.86 
 
 
228 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15781  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  29.9 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0899823  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16611  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  27.23 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.213566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1186  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.96 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0473  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  32.97 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2203  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  33.33 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1552  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  26.73 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16381  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.25 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16491  putative c-type cytochrome biogenesis protein CcdA  25.74 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1218  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.21 
 
 
233 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0854  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.49 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0551  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000556643  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1879  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.86 
 
 
228 aa  55.5  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2398  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane protein  31.38 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.493199  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4485  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  30.77 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3204  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.57 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000564302 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3443  hypothetical protein  29.57 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.11211  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2284  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.84 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000156188  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1532  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  26.26 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739338  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_10432  predicted protein  31.63 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000896469  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0522  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.02 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0219549  hitchhiker  0.00315047 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.3 
 
 
229 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1270  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.08 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3250  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  29.08 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0077031  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0174  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.03 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0584  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.97 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0123641  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0549  cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  28.97 
 
 
248 aa  49.3  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000031904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3668  putative transmembrane cytochrome C biogenesis protein, putative SoxV protein  30.14 
 
 
244 aa  48.9  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389509  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3272  Protein-disulfide reductase  26.94 
 
 
611 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0226485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2809  cytochrome c biogenesis protein  28.04 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.427201 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4999  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.79 
 
 
244 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.72 
 
 
611 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0831  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  25.12 
 
 
224 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0602188  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4148  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.2 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2512  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.33 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.308751  normal  0.32204 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  34.13 
 
 
639 aa  45.4  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.8 
 
 
595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.8 
 
 
595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.8 
 
 
595 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07210  cytochrome c biogenesis protein  28.57 
 
 
274 aa  45.4  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4210  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.82 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0502  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.75 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3204  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  29.86 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2134  putative cytochrome c-type biogenesis protein CcdA  34.26 
 
 
248 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0478142  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0323  cytochrome c biogenesis protein-like  31.21 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0753  putative cytochrome c-type biogenesis protein  27.17 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.117718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1525  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.63 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  28.19 
 
 
610 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.14 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.14 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.14 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.14 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.14 
 
 
567 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  31.82 
 
 
565 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  31.82 
 
 
565 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1277  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  28.99 
 
 
300 aa  43.5  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.41 
 
 
602 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.82 
 
 
565 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.61 
 
 
616 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.61 
 
 
616 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04460  methionine-R-sulfoxide reductase/methionine-S-sulfoxide reductase  29.47 
 
 
735 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.361205  normal  0.714911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2733  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.34 
 
 
317 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0356838  normal  0.0597692 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.37 
 
 
561 aa  43.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.28 
 
 
624 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1457  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.14 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00340788  normal  0.584916 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.36 
 
 
592 aa  42.7  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  29.38 
 
 
570 aa  42.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0722  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.43 
 
 
583 aa  42  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0445  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.35 
 
 
250 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.362789  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0808  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  33.8 
 
 
248 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.689366  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04380  cytochrome c biogenesis protein  27.03 
 
 
396 aa  42  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181653 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0535  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.38 
 
 
948 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1948  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  21.79 
 
 
222 aa  41.6  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>