More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1008 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1011  major facilitator superfamily MFS_1  99.52 
 
 
414 aa  788    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1008  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
414 aa  790    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  96.86 
 
 
414 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  77.78 
 
 
414 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  44.26 
 
 
474 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  46.12 
 
 
446 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  45.65 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  45.04 
 
 
441 aa  305  8.000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  36.93 
 
 
424 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
419 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  41.4 
 
 
432 aa  279  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  43.18 
 
 
412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  36.86 
 
 
423 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  43.78 
 
 
418 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 
421 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  39.43 
 
 
418 aa  252  7e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  37.34 
 
 
413 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.16 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.58 
 
 
413 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  35.34 
 
 
412 aa  243  5e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  34.6 
 
 
409 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
401 aa  239  5e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1281  major facilitator transporter  31.96 
 
 
413 aa  239  5.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.835892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  38.99 
 
 
413 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7163  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 
414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.886054  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  38.5 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  40.83 
 
 
426 aa  227  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
431 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  41.67 
 
 
474 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  36.77 
 
 
410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
408 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
418 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  33.67 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1327  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  39.62 
 
 
435 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  34.84 
 
 
421 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  42.64 
 
 
426 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  33.25 
 
 
429 aa  210  5e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1677  hypothetical protein  35.37 
 
 
435 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
418 aa  207  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3976  major facilitator transporter  36.61 
 
 
407 aa  207  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0107  hypothetical protein  32.5 
 
 
423 aa  206  6e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0053883 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  33.83 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  37.7 
 
 
413 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5797  hypothetical protein  35.9 
 
 
419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  35.13 
 
 
441 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  35.84 
 
 
446 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3035  MFS family transporter  36.63 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  36.48 
 
 
416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3762  major facilitator transporter  36.63 
 
 
425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 
450 aa  195  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
456 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  37.4 
 
 
414 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
453 aa  193  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3542  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 
405 aa  193  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00114528  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
442 aa  193  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  31.62 
 
 
436 aa  193  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  38.52 
 
 
442 aa  193  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 
403 aa  193  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 
461 aa  192  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  36.55 
 
 
424 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 
420 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  39.02 
 
 
450 aa  191  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  37.24 
 
 
412 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  30.64 
 
 
403 aa  189  8e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 
440 aa  189  8e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  37.33 
 
 
416 aa  189  8e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 
441 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 
424 aa  187  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 
446 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
410 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 
494 aa  186  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  36.39 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  29.55 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  33 
 
 
431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 
404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0746  hypothetical protein  29.83 
 
 
431 aa  184  3e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0165656  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  36.87 
 
 
413 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  36.99 
 
 
413 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  36.99 
 
 
413 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
428 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  35.6 
 
 
405 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
404 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  34.44 
 
 
457 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  35.09 
 
 
452 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  35.47 
 
 
425 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  36.65 
 
 
452 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  34.84 
 
 
405 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3596  major facilitator superfamily MFS_1  36.48 
 
 
417 aa  178  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  34.75 
 
 
418 aa  177  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 
417 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 
419 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  38.61 
 
 
378 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  37.34 
 
 
441 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 
476 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 
436 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  35.12 
 
 
428 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>