31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1005 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1005  protein of unknown function DUF101  100 
 
 
145 aa  270  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1008  hypothetical protein  98.62 
 
 
145 aa  266  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.346988  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0947  hypothetical protein  91.72 
 
 
145 aa  221  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0987  hypothetical protein  71.03 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1264  protein of unknown function DUF101  28.87 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0688  hypothetical protein  31.43 
 
 
150 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0414002  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1747  protein of unknown function DUF101  26.24 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0271  hypothetical protein  30.5 
 
 
165 aa  58.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1251  archease family protein  27.27 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1078  protein of unknown function DUF101  28.67 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0655  protein of unknown function DUF101  28.77 
 
 
143 aa  55.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1652  hypothetical protein  25.52 
 
 
135 aa  52  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1392  hypothetical protein  31.82 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0196  hypothetical protein  31.69 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.30479  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0707  hypothetical protein  29.14 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_726  hypothetical protein  25.71 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3853  hypothetical protein  31.72 
 
 
138 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1373  hypothetical protein  28.37 
 
 
141 aa  47  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2143  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.706789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0822  hypothetical protein  29.29 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.303013  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1831  hypothetical protein  30.26 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000057693  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1685  hypothetical protein  29.61 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0257186 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2208  archease family protein  29.79 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000144175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1949  protein of unknown function DUF101  30.5 
 
 
141 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000093626  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0569  hypothetical protein  30.87 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0018  hypothetical protein  28.47 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000044858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2728  hypothetical protein  30.61 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.21951  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0128  hypothetical protein  24.64 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0741  hypothetical protein  25.68 
 
 
138 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3180  hypothetical protein  22.63 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0121  hypothetical protein  25.71 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000001565  hitchhiker  0.0000415863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>