More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0886 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0886  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.301364  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0882  ABC-2 type transporter  98.02 
 
 		 253 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0836  ABC transporter, inner membrane subunit  96.84 
 
 		 253 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0898  ABC-2 type transporter  78.66 
 
 		 253 aa  346  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2121  ABC transporter, permease protein  43.78 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2615  ABC-2 type transporter  44.18 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.747872  hitchhiker  0.00151672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5173  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108513 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0663  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3260  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0633139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5108  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  43.27 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0607  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.837549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2833  ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0324  ABC-2 type transporter  44.76 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0584539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0427  ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 		 257 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2686  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.859674  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0421  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0400  ABC-2 type transporter  45.24 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.732955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3995  ABC-2 type transporter  41.77 
 
 		 256 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0197  ABC transporter permease  41.83 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.737997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0189  ABC transporter permease protein  41.83 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0188  ABC transporter permease  41.83 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.137921  normal  0.864827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0192  ABC transporter permease  41.83 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.333926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0205  ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0461  hypothetical protein  39.76 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3519  ABC efflux pump, inner membrane subunit  44.44 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  0.275506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0121  ABC transporter, permease protein  42.4 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0827  putative transmembrane protein  45.38 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00127  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3474  ABC-2 type transporter  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0132  ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3531  ABC-2 type transporter  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2997  ABC transporter, permease protein  44.05 
 
 		 251 aa  198  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0138  ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00126  hypothetical protein  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0136  ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0130  ABC transporter, permease protein  46.33 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002558  ABC-type multidrug transport system permease component  41.7 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.644442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0540  ABC transporter, inner membrane subunit  40.16 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0348  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.431352  normal  0.251356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0339  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4411  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.309984  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2718  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3728  ABC-2 type transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3235  ABC-2 type transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.460161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  39.11 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3697  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0800  hypothetical protein  41.53 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.200073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3670  ABC-2 type transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.549508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1784  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2769  ABC-2 type transporter, permease protein  44.44 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0692  ABC-2 type transporter  42.34 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.815374  normal  0.797242 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5044  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.917306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4521  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3233  ABC-2 type transporter  43.2 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0808  hypothetical protein  41.3 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.283236  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2886  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0831309 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1607  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 253 aa  195  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0979931  normal  0.144248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02790  permease  42.17 
 
 		 263 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1583  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0567734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1896  ABC transporter  42.13 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.312969  hitchhiker  0.0000781572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2088  ABC-2 type transporter  37.1 
 
 		 253 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0318264  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1005  ABC transporter, permease protein  40.4 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03555  ABC-type multidrug transport system, permease component  40 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3534  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0881  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1098  ABC-2 type transporter  40.82 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1352  hypothetical protein  41.48 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000725132  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0676  ABC-2 type transporter  44.7 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.655554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2326  ABC-2 type transporter  36.69 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  38.15 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  39.36 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1497  hypothetical protein  38.55 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1332  ABC-2 type transporter  39.92 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.993972  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2362  ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0916375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2763  ABC-2 type transporter  43.36 
 
 		 251 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0849  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.8 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.227676  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  39.6 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0749  ABC-2 type transporter  37.9 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.41583 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1016  ABC transporter permease  40.8 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.875005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3564  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.460574  hitchhiker  0.0000462468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1631  hypothetical protein  38.96 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 259 aa  191  8e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1471  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 		 259 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.75 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3348  ABC transporter, permease protein  40.8 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0192428  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3476  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 		 256 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0121  putative permease  40.65 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3854  ABC transporter, permease protein  38.55 
 
 		 262 aa  189  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.605289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5529  ABC-2 type transporter  42.63 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0394  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  41.94 
 
 		 254 aa  189  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2524  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.438838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1025  ABC-2 type transporter  41.83 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0880893  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0379  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1714  ABC-2 type transporter  39.68 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0411  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 259 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.164581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0447  ABC-2 type transporter  41.15 
 
 		 259 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3270  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1860  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 		 257 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>