77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0854 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_0850  SCO1/SenC family protein  99.66 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0854  SCO1/SenC family protein  100 
 
 		 291 aa  581  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0802  SCO1/SenC family protein  94.5 
 
 		 291 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.953306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0847  SCO1/SenC family protein  75 
 
 		 283 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0228  electron transport protein SCO1/SenC  42.24 
 
 		 277 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.133565  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2997  electron transport protein SCO1/SenC  35.74 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3988  electron transport protein SCO1/SenC  39.75 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1523  electron transport protein SCO1/SenC  40.35 
 
 		 279 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1589  electron transport protein SCO1/SenC  35.2 
 
 		 287 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0415  hypothetical protein  39.67 
 
 		 299 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1822  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  34.32 
 
 		 313 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000175275  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2525  SCO1/SenC family protein  30 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.2485899999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2418  hypothetical protein  32.64 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0278371  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0248  hypothetical protein  31.11 
 
 		 274 aa  149  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000174158  hitchhiker  0.00180581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0218  hypothetical protein  35.02 
 
 		 278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.540785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0537  hypothetical protein  32.07 
 
 		 415 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0290591 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0042  hypothetical protein  33.48 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5949  electron transport protein SCO1/SenC  34.31 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0829  hypothetical protein  34.89 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.449378  normal  0.121929 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0041  hypothetical protein  32.49 
 
 		 276 aa  142  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2276  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like  37.29 
 
 		 276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1675  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.44 
 
 		 276 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1599  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC-like protein  36.02 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.613564  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1542  uncharacterized protein SCO1/SenC/PrrC  31.16 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1344  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00606517  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4181  hypothetical protein  33.94 
 
 		 262 aa  122  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.149601  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2707  hypothetical protein  36.63 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4434  SCO1/SenC family protein  29.51 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0517752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6887  hypothetical protein  29.85 
 
 		 342 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5012  hypothetical protein  32.27 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.460518  normal  0.137531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5818  hypothetical protein  28.12 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110023  hitchhiker  0.00869837 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  31.79 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  27.56 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2283  electron transport protein SCO1/SenC  28.7 
 
 		 218 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.897597  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3488  electron transport protein SCO1/SenC  28.7 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1977  electron transport protein SCO1/SenC  26.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  26.02 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2449  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.010405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2458  electron transport protein SCO1/SenC  27.83 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  24.86 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1660  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0522  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  52.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0705  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0595  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  52.4  0.000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4130  electron transport protein SCO1/SenC  22.7 
 
 		 194 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4017  electron transport protein SCO1/SenC  22.7 
 
 		 194 aa  52.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0753  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0614736  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 187 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  31.61 
 
 		 203 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1398  SCO1/SenC family protein  24.32 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2014  SCO1/SenC family protein  24.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0132018  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  27.5 
 
 		 213 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0318  SCO1/SenC family protein/methylamine utilization protein MauG, putative  27.54 
 
 		 626 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2109  SCO1/SenC family protein  23.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  27.27 
 
 		 190 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03040  signal peptide protein  24.65 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2969  electron transport protein SCO1/SenC  27.23 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000121806  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 198 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2292  putative transmembrane protein  30.19 
 
 		 207 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.765986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0879  SCO1/SenC family protein  24.09 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  29.87 
 
 		 209 aa  45.8  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  26.67 
 
 		 202 aa  45.8  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  22 
 
 		 283 aa  45.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  30.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 		 207 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.29 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  23.31 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4161  electron transport protein SCO1/SenC  28.1 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.992536 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  27.55 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 		 205 aa  44.3  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  29.68 
 
 		 201 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  28.78 
 
 		 199 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  26.77 
 
 		 205 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  27.33 
 
 		 205 aa  42.7  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  31.29 
 
 		 191 aa  42.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  25.76 
 
 		 340 aa  42.4  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>