92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0784 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0784  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
294 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0784  CRISPR-associated protein Cas1  96.6 
 
 
294 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00721188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0949  CRISPR-associated Cas1 family protein  59.04 
 
 
298 aa  333  2e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0628062  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0486  CRISPR-associated protein Cas1  61.28 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0583925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0930  CRISPR-associated Cas1 family protein  58.7 
 
 
296 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0347  CRISPR-associated Cas1 family protein  60.35 
 
 
293 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3220  cas1: CRISPR-associated protein Cas1  57.59 
 
 
291 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.615148  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2234  CRISPR-associated protein Cas1  54.39 
 
 
297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1530  CRISPR-associated protein Cas1  38.38 
 
 
327 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00231307  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1392  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.63 
 
 
306 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00872  CRISPR-associated protein Cas1  35.13 
 
 
306 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0403  CRISPR-associated protein Cas1  36.92 
 
 
305 aa  157  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0402524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0957  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.94 
 
 
305 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2474  CRISPR-associated protein Cas1  37.05 
 
 
307 aa  155  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2894  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.3 
 
 
305 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3755  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.14 
 
 
304 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.44675 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0933  CRISPR-associated protein Cas1  35.59 
 
 
305 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2989  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.02 
 
 
309 aa  155  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.786147  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0928  CRISPR-associated protein Cas1  38.3 
 
 
303 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3092  crispr-associated protein Cas1  35.74 
 
 
305 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79761  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2685  CRISPR-associated protein Cas1  37.55 
 
 
315 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000995939  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3148  CRISPR-associated protein Cas1  35.23 
 
 
305 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2337  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 
307 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00747033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3541  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.33 
 
 
307 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.608984  normal  0.0531608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2883  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.59 
 
 
307 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.921772  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4088  CRISPR-associated protein Cas1  34.58 
 
 
303 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0463414  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2830  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.44 
 
 
306 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3057  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.59 
 
 
306 aa  149  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0964  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.59 
 
 
306 aa  149  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0645  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.38 
 
 
315 aa  149  7e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3585  CRISPR-associated protein Cas1  34.88 
 
 
307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4008  CRISPR-associated protein Cas1  35.23 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1808  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.24 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0858  CRISPR-associated Cas1 family protein  38.46 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3320  CRISPR-associated Cas1 family protein  39.24 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.118981  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3013  CRISPR-associated protein Cas1  34.8 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00425226  decreased coverage  0.00852288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1977  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.02 
 
 
320 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147845  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1592  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.9 
 
 
305 aa  147  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.328898 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3132  CRISPR-associated protein Cas1  35.23 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0232  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.66 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3066  CRISPR-associated protein Cas1  34.88 
 
 
306 aa  145  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3249  crispr-associated protein Cas1  34.88 
 
 
306 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0835  CRISPR-associated Cas1 family protein  36 
 
 
307 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0946  CRISPR-associated protein Cas1  38.68 
 
 
324 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.291315  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2444  CRISPR-associated protein Cas1  33.48 
 
 
303 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68429 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1375  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.94 
 
 
299 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00127759  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1901  CRISPR-associated protein Cas1  34.3 
 
 
324 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0599  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.18 
 
 
303 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000773136  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2636  CRISPR-associated Cas1 family protein  37.3 
 
 
316 aa  143  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1602  CRISPR-associated protein Cas1  34.43 
 
 
303 aa  142  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.19087  normal  0.843574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5409  CRISPR-associated protein Cas1  36.86 
 
 
314 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.031752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1236  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00257289  normal  0.15537 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0169  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.42 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2676  CRISPR-associated protein Cas1  32.68 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0906  CRISPR-associated protein Cas1  33.86 
 
 
291 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16838  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3904  CRISPR-associated protein Cas1  32.97 
 
 
323 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.242948  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0983  CRISPR-associated protein Cas1  33.67 
 
 
314 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17300  CRISPR-associated protein, Cas1 family  37.76 
 
 
342 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1286  CRISPR-associated protein Cas1  34.18 
 
 
327 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2164  CRISPR-associated protein Cas1  31.56 
 
 
291 aa  132  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0192086  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0422  CRISPR-associated protein Cas1  39.47 
 
 
319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0368078  normal  0.0376622 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0765  CRISPR-associated endonuclease Cas1, ECOLI subtype  27.21 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0747275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3049  CRISPR-associated protein Cas1  32.76 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000891408  hitchhiker  0.000905677 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4348  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.68 
 
 
277 aa  127  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17190  CRISPR-associated protein, Cas1 family  36.11 
 
 
328 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.866435  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1413  CRISPR-associated protein Cas1  30.45 
 
 
291 aa  126  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0233391  normal  0.0713718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0023  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.89 
 
 
330 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408897  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2578  CRISPR-associated Cas1 family protein  36.21 
 
 
322 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0729404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1587  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.29 
 
 
332 aa  119  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0375026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1942  hypothetical cytosolic protein  22.29 
 
 
322 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2719  hypothetical protein  40.96 
 
 
130 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1401  CRISPR-associated Cas1 family protein  21.9 
 
 
325 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612871  normal  0.155418 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.58 
 
 
402 aa  49.3  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  33.33 
 
 
545 aa  49.3  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  26.14 
 
 
326 aa  47.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  33 
 
 
731 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0927  CRISPR-associated protein Cas1  31.31 
 
 
207 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0929  CRISPR-associated protein Cas1  33 
 
 
731 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.400864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33350  hypothetical protein  24.06 
 
 
324 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.142175 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2459  CRISPR-associated protein Cas1  28.78 
 
 
727 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.670262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  28.12 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.45 
 
 
325 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  27.78 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  21.67 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.87 
 
 
398 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  27.62 
 
 
326 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  26.09 
 
 
325 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.64 
 
 
326 aa  44.3  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.49 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0391  CRISPR-associated protein Cas1  20.28 
 
 
404 aa  42.7  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6020  CRISPR-associated protein Cas1  24.6 
 
 
351 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0853695  normal  0.491658 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2751  hypothetical protein  22.83 
 
 
295 aa  42.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00117385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>