More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0769 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0776  DNA repair protein RecN  79.62 
 
 
611 aa  781    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163902  normal  0.739738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0732  DNA repair protein RecN  98.23 
 
 
606 aa  961    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.813778  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0769  DNA repair protein RecN  99.17 
 
 
606 aa  1127    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0769  DNA repair protein RecN  100 
 
 
606 aa  1137    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2064  DNA repair protein RecN  43.25 
 
 
558 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.488529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0942  DNA repair protein RecN  43.52 
 
 
554 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2472  DNA repair protein RecN  42.16 
 
 
605 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400775 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1578  DNA repair protein RecN  42.18 
 
 
556 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2680  DNA repair protein RecN  41.94 
 
 
554 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0596  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1666  DNA repair protein RecN  36.75 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3096  DNA repair protein RecN  38.97 
 
 
574 aa  352  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1707  DNA repair protein RecN  40.61 
 
 
553 aa  351  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1047  DNA repair protein RecN  35.64 
 
 
580 aa  346  6e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266577  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2516  DNA repair protein RecN  37.2 
 
 
572 aa  344  2e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1773  DNA repair protein RecN  41.74 
 
 
553 aa  343  4e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000824865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.28 
 
 
565 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2444  DNA repair protein RecN  41.37 
 
 
553 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0113802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2326  DNA repair protein RecN  40.49 
 
 
560 aa  333  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000910227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  40.72 
 
 
560 aa  332  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1779  DNA repair protein RecN  37.62 
 
 
581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.666721 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1896  DNA repair protein RecN  34.36 
 
 
567 aa  327  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000247727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0370  DNA repair protein RecN  39.33 
 
 
578 aa  326  6e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0814  DNA repair protein RecN  32.14 
 
 
570 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3916  DNA repair protein  33.84 
 
 
579 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000027559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  33.84 
 
 
579 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 
579 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  34.01 
 
 
579 aa  317  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4304  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 
579 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000470862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4194  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 
579 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.9666000000000002e-33 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3927  DNA repair protein  33.5 
 
 
583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0317713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2867  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 
579 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4246  DNA repair protein RecN  33.56 
 
 
583 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00786878  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4078  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4397  DNA repair protein RecN  33.5 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000441756  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  36.47 
 
 
555 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  34.72 
 
 
565 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  33.67 
 
 
573 aa  310  4e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.66 
 
 
568 aa  309  8e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2651  DNA repair protein  38.99 
 
 
569 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.829393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  38.23 
 
 
568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1691  DNA repair protein RecN  33.28 
 
 
557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.893605  hitchhiker  0.00244544 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1507  DNA repair protein RecN  37.59 
 
 
558 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1544  DNA repair protein RecN  31.18 
 
 
566 aa  302  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.11 
 
 
557 aa  300  5e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.19 
 
 
559 aa  300  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0254  DNA repair protein RecN  34.82 
 
 
573 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3966  DNA repair protein RecN  34.67 
 
 
556 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.284551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0701  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 
567 aa  295  1e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0611  DNA repair protein RecN  39.43 
 
 
558 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0450  DNA repair protein RecN  39.43 
 
 
558 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  38.07 
 
 
589 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1274  DNA repair protein RecN  34.43 
 
 
595 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0968  DNA repair protein RecN  36.81 
 
 
567 aa  294  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.858596  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1055  DNA repair protein RecN  33.62 
 
 
588 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01182  DNA repair protein RecN  38.34 
 
 
554 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.239665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0361  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 
601 aa  294  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00213355  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1749  DNA repair protein RecN  33.11 
 
 
574 aa  293  6e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0756  DNA repair ATPase  32.41 
 
 
562 aa  293  7e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.00000000414406  hitchhiker  0.0000280252 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  33.91 
 
 
553 aa  291  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2627  DNA repair protein RecN  27.86 
 
 
574 aa  290  5.0000000000000004e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.434189  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0934  DNA repair protein RecN  32.93 
 
 
588 aa  290  6e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.590863  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3025  DNA repair protein RecN  39.12 
 
 
569 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  33.73 
 
 
553 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  33.91 
 
 
553 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  33.73 
 
 
553 aa  290  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0576  DNA repair protein RecN  32.47 
 
 
568 aa  289  8e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  33.73 
 
 
553 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.72 
 
 
559 aa  289  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3158  DNA repair protein RecN  38.91 
 
 
584 aa  289  1e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0998846  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  33.73 
 
 
553 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  33.73 
 
 
553 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2900  recombination and repair protein  33.56 
 
 
553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.004413  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2829  recombination and repair protein  34.03 
 
 
553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00407233  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2879  recombination and repair protein  34.03 
 
 
553 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.158329 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
546 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2899  recombination and repair protein  34.03 
 
 
553 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  39.86 
 
 
546 aa  287  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2897  recombination and repair protein  34.03 
 
 
553 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3011  recombination and repair protein  33.85 
 
 
553 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  32.06 
 
 
555 aa  286  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1515  recombination protein N  36.89 
 
 
557 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_923  DNA repair protein  33.1 
 
 
588 aa  286  7e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0553147  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1578  DNA repair protein RecN  31.2 
 
 
559 aa  286  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1611  DNA repair protein RecN  31.2 
 
 
559 aa  286  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000188364  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2421  DNA repair protein RecN  36.92 
 
 
563 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.955613  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  36.1 
 
 
552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  33.56 
 
 
553 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0594  DNA repair protein RecN  32.99 
 
 
569 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0859323 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2069  DNA repair protein RecN  29.51 
 
 
565 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  35.13 
 
 
556 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1335  DNA repair protein RecN  29.39 
 
 
551 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0119  DNA repair protein RecN  37.44 
 
 
599 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1783  DNA repair protein RecN  29.17 
 
 
565 aa  283  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2499  DNA repair protein RecN  30.74 
 
 
561 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1458  DNA repair protein RecN  36.54 
 
 
557 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0380589  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1080  DNA repair protein RecN  30 
 
 
558 aa  283  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2579  DNA repair protein RecN  32.19 
 
 
562 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.183283 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3397  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 
586 aa  282  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00306133  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  36.99 
 
 
557 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>